Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ48

Srl, Sarcalumenin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrlQ7TQ48 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrlQ7TQ48 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrlQ7TQ48 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SrlQ7TQ48 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrlQ7TQ48 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrlQ7TQ48 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SrlQ7TQ48 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SrlQ7TQ48 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SrlQ7TQ48 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SrlQ7TQ48 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SrlQ7TQ48 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SrlQ7TQ48 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SrlQ7TQ48 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SrlQ7TQ48 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SrlQ7TQ48 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SrlQ7TQ48 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SrlQ7TQ48 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SrlQ7TQ48 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SrlQ7TQ48 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrlQ7TQ48 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrlQ7TQ48 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrlQ7TQ48 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrlQ7TQ48 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrlQ7TQ48 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SrlQ7TQ48 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SrlQ7TQ48 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SrlQ7TQ48 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SrlQ7TQ48 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SrlQ7TQ48 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SrlQ7TQ48 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SrlQ7TQ48 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrlQ7TQ48 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrlQ7TQ48 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SrlQ7TQ48 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrlQ7TQ48 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrlQ7TQ48 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SrlQ7TQ48 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SrlQ7TQ48 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SrlQ7TQ48 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SrlQ7TQ48 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SrlQ7TQ48 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrlQ7TQ48 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrlQ7TQ48 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrlQ7TQ48 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrlQ7TQ48 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SrlQ7TQ48 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SrlQ7TQ48 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SrlQ7TQ48 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SrlQ7TQ48 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SrlQ7TQ48 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SrlQ7TQ48 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SrlQ7TQ48 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SrlQ7TQ48 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SrlQ7TQ48 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SrlQ7TQ48 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SrlQ7TQ48 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SrlQ7TQ48 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrlQ7TQ48 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrlQ7TQ48 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrlQ7TQ48 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrlQ7TQ48 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrlQ7TQ48 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrlQ7TQ48 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrlQ7TQ48 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrlQ7TQ48 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrlQ7TQ48 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SrlQ7TQ48 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SrlQ7TQ48 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SrlQ7TQ48 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SrlQ7TQ48 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SrlQ7TQ48 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SrlQ7TQ48 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SrlQ7TQ48 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SrlQ7TQ48 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SrlQ7TQ48 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SrlQ7TQ48 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SrlQ7TQ48 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrlQ7TQ48 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrlQ7TQ48 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrlQ7TQ48 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrlQ7TQ48 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SrlQ7TQ48 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SrlQ7TQ48 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SrlQ7TQ48 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SrlQ7TQ48 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SrlQ7TQ48 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SrlQ7TQ48 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SrlQ7TQ48 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SrlQ7TQ48 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SrlQ7TQ48 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SrlQ7TQ48 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SrlQ7TQ48 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SrlQ7TQ48 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SrlQ7TQ48 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SrlQ7TQ48 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SrlQ7TQ48 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SrlQ7TQ48 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SrlQ7TQ48 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SrlQ7TQ48 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SrlQ7TQ48 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms