Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Prrc2bQ7TPM1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Prrc2bQ7TPM1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Prrc2bQ7TPM1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Prrc2bQ7TPM1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Prrc2bQ7TPM1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Prrc2bQ7TPM1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Prrc2bQ7TPM1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Prrc2bQ7TPM1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Prrc2bQ7TPM1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Prrc2bQ7TPM1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Prrc2bQ7TPM1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Prrc2bQ7TPM1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Prrc2bQ7TPM1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Prrc2bQ7TPM1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Prrc2bQ7TPM1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Prrc2bQ7TPM1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Prrc2bQ7TPM1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Prrc2bQ7TPM1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Prrc2bQ7TPM1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Prrc2bQ7TPM1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Prrc2bQ7TPM1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Prrc2bQ7TPM1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Prrc2bQ7TPM1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Prrc2bQ7TPM1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Prrc2bQ7TPM1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Prrc2bQ7TPM1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Prrc2bQ7TPM1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Prrc2bQ7TPM1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Prrc2bQ7TPM1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Prrc2bQ7TPM1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Prrc2bQ7TPM1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Prrc2bQ7TPM1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Prrc2bQ7TPM1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Prrc2bQ7TPM1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Prrc2bQ7TPM1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Prrc2bQ7TPM1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Prrc2bQ7TPM1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Prrc2bQ7TPM1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Prrc2bQ7TPM1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Prrc2bQ7TPM1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Prrc2bQ7TPM1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Prrc2bQ7TPM1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Prrc2bQ7TPM1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Prrc2bQ7TPM1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Prrc2bQ7TPM1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Prrc2bQ7TPM1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Prrc2bQ7TPM1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Prrc2bQ7TPM1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Prrc2bQ7TPM1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Prrc2bQ7TPM1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Prrc2bQ7TPM1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Prrc2bQ7TPM1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Prrc2bQ7TPM1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Prrc2bQ7TPM1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Prrc2bQ7TPM1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Prrc2bQ7TPM1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Prrc2bQ7TPM1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Prrc2bQ7TPM1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Prrc2bQ7TPM1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Prrc2bQ7TPM1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Prrc2bQ7TPM1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Prrc2bQ7TPM1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Prrc2bQ7TPM1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Prrc2bQ7TPM1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Prrc2bQ7TPM1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Prrc2bQ7TPM1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Prrc2bQ7TPM1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Prrc2bQ7TPM1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Prrc2bQ7TPM1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Prrc2bQ7TPM1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Prrc2bQ7TPM1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Prrc2bQ7TPM1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Prrc2bQ7TPM1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Prrc2bQ7TPM1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Prrc2bQ7TPM1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Prrc2bQ7TPM1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Prrc2bQ7TPM1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Prrc2bQ7TPM1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Prrc2bQ7TPM1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Prrc2bQ7TPM1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Prrc2bQ7TPM1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Prrc2bQ7TPM1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Prrc2bQ7TPM1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Prrc2bQ7TPM1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Prrc2bQ7TPM1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Prrc2bQ7TPM1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Prrc2bQ7TPM1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Prrc2bQ7TPM1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Prrc2bQ7TPM1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Prrc2bQ7TPM1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Prrc2bQ7TPM1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Prrc2bQ7TPM1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms