Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf2Q7TMI3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf2Q7TMI3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf2Q7TMI3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uhrf2Q7TMI3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uhrf2Q7TMI3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uhrf2Q7TMI3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uhrf2Q7TMI3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uhrf2Q7TMI3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf2Q7TMI3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf2Q7TMI3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf2Q7TMI3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Uhrf2Q7TMI3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uhrf2Q7TMI3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uhrf2Q7TMI3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uhrf2Q7TMI3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uhrf2Q7TMI3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uhrf2Q7TMI3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Uhrf2Q7TMI3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Uhrf2Q7TMI3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Uhrf2Q7TMI3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Uhrf2Q7TMI3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uhrf2Q7TMI3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uhrf2Q7TMI3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uhrf2Q7TMI3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uhrf2Q7TMI3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uhrf2Q7TMI3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uhrf2Q7TMI3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uhrf2Q7TMI3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf2Q7TMI3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf2Q7TMI3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf2Q7TMI3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf2Q7TMI3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf2Q7TMI3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf2Q7TMI3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf2Q7TMI3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf2Q7TMI3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf2Q7TMI3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf2Q7TMI3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf2Q7TMI3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf2Q7TMI3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf2Q7TMI3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uhrf2Q7TMI3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uhrf2Q7TMI3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uhrf2Q7TMI3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Uhrf2Q7TMI3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uhrf2Q7TMI3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Uhrf2Q7TMI3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf2Q7TMI3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf2Q7TMI3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf2Q7TMI3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf2Q7TMI3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf2Q7TMI3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf2Q7TMI3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf2Q7TMI3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf2Q7TMI3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf2Q7TMI3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf2Q7TMI3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf2Q7TMI3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf2Q7TMI3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf2Q7TMI3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf2Q7TMI3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf2Q7TMI3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf2Q7TMI3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf2Q7TMI3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf2Q7TMI3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uhrf2Q7TMI3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Uhrf2Q7TMI3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms