Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nme8Q715T0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nme8Q715T0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Nme8Q715T0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Nme8Q715T0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nme8Q715T0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nme8Q715T0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Nme8Q715T0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nme8Q715T0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nme8Q715T0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nme8Q715T0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nme8Q715T0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nme8Q715T0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nme8Q715T0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nme8Q715T0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nme8Q715T0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nme8Q715T0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nme8Q715T0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nme8Q715T0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nme8Q715T0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nme8Q715T0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nme8Q715T0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nme8Q715T0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nme8Q715T0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Nme8Q715T0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Nme8Q715T0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Nme8Q715T0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nme8Q715T0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nme8Q715T0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nme8Q715T0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nme8Q715T0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Nme8Q715T0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Nme8Q715T0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nme8Q715T0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nme8Q715T0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nme8Q715T0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nme8Q715T0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nme8Q715T0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Nme8Q715T0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nme8Q715T0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nme8Q715T0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Nme8Q715T0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Nme8Q715T0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Nme8Q715T0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nme8Q715T0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nme8Q715T0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nme8Q715T0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nme8Q715T0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Nme8Q715T0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nme8Q715T0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nme8Q715T0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nme8Q715T0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nme8Q715T0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nme8Q715T0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Nme8Q715T0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nme8Q715T0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nme8Q715T0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nme8Q715T0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nme8Q715T0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nme8Q715T0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nme8Q715T0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nme8Q715T0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nme8Q715T0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nme8Q715T0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nme8Q715T0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nme8Q715T0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nme8Q715T0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nme8Q715T0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nme8Q715T0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nme8Q715T0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms