Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ7

Spcs3, Signal peptidase complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs3Q6ZWQ7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spcs3Q6ZWQ7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spcs3Q6ZWQ7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spcs3Q6ZWQ7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spcs3Q6ZWQ7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spcs3Q6ZWQ7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spcs3Q6ZWQ7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spcs3Q6ZWQ7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spcs3Q6ZWQ7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spcs3Q6ZWQ7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spcs3Q6ZWQ7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Spcs3Q6ZWQ7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spcs3Q6ZWQ7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spcs3Q6ZWQ7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spcs3Q6ZWQ7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spcs3Q6ZWQ7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spcs3Q6ZWQ7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spcs3Q6ZWQ7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spcs3Q6ZWQ7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spcs3Q6ZWQ7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spcs3Q6ZWQ7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spcs3Q6ZWQ7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spcs3Q6ZWQ7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spcs3Q6ZWQ7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spcs3Q6ZWQ7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spcs3Q6ZWQ7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spcs3Q6ZWQ7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Spcs3Q6ZWQ7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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