Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cxcl3Q6W5C0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cxcl3Q6W5C0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cxcl3Q6W5C0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cxcl3Q6W5C0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cxcl3Q6W5C0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cxcl3Q6W5C0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cxcl3Q6W5C0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cxcl3Q6W5C0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cxcl3Q6W5C0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxcl3Q6W5C0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxcl3Q6W5C0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxcl3Q6W5C0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxcl3Q6W5C0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxcl3Q6W5C0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxcl3Q6W5C0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxcl3Q6W5C0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxcl3Q6W5C0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxcl3Q6W5C0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cxcl3Q6W5C0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cxcl3Q6W5C0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cxcl3Q6W5C0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cxcl3Q6W5C0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxcl3Q6W5C0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxcl3Q6W5C0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxcl3Q6W5C0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxcl3Q6W5C0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxcl3Q6W5C0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxcl3Q6W5C0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxcl3Q6W5C0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cxcl3Q6W5C0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cxcl3Q6W5C0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cxcl3Q6W5C0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cxcl3Q6W5C0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cxcl3Q6W5C0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cxcl3Q6W5C0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cxcl3Q6W5C0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cxcl3Q6W5C0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cxcl3Q6W5C0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cxcl3Q6W5C0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cxcl3Q6W5C0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cxcl3Q6W5C0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cxcl3Q6W5C0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cxcl3Q6W5C0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cxcl3Q6W5C0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cxcl3Q6W5C0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cxcl3Q6W5C0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cxcl3Q6W5C0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cxcl3Q6W5C0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxcl3Q6W5C0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxcl3Q6W5C0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxcl3Q6W5C0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxcl3Q6W5C0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cxcl3Q6W5C0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cxcl3Q6W5C0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Cxcl3Q6W5C0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cxcl3Q6W5C0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cxcl3Q6W5C0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxcl3Q6W5C0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxcl3Q6W5C0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxcl3Q6W5C0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxcl3Q6W5C0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxcl3Q6W5C0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cxcl3Q6W5C0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cxcl3Q6W5C0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms