Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc88cQ6VGS5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc88cQ6VGS5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc88cQ6VGS5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc88cQ6VGS5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc88cQ6VGS5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc88cQ6VGS5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc88cQ6VGS5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc88cQ6VGS5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc88cQ6VGS5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc88cQ6VGS5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc88cQ6VGS5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc88cQ6VGS5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc88cQ6VGS5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc88cQ6VGS5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc88cQ6VGS5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc88cQ6VGS5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc88cQ6VGS5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc88cQ6VGS5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc88cQ6VGS5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc88cQ6VGS5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc88cQ6VGS5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc88cQ6VGS5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc88cQ6VGS5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc88cQ6VGS5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc88cQ6VGS5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc88cQ6VGS5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc88cQ6VGS5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc88cQ6VGS5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc88cQ6VGS5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc88cQ6VGS5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc88cQ6VGS5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ccdc88cQ6VGS5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ccdc88cQ6VGS5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc88cQ6VGS5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc88cQ6VGS5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc88cQ6VGS5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc88cQ6VGS5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc88cQ6VGS5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc88cQ6VGS5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc88cQ6VGS5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc88cQ6VGS5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc88cQ6VGS5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc88cQ6VGS5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc88cQ6VGS5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc88cQ6VGS5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc88cQ6VGS5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc88cQ6VGS5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc88cQ6VGS5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc88cQ6VGS5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc88cQ6VGS5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc88cQ6VGS5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc88cQ6VGS5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc88cQ6VGS5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc88cQ6VGS5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc88cQ6VGS5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc88cQ6VGS5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc88cQ6VGS5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc88cQ6VGS5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc88cQ6VGS5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms