Protein–RNA interactions for Protein: Q6RKD8

Flrt1, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flrt1Q6RKD8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Flrt1Q6RKD8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Flrt1Q6RKD8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Flrt1Q6RKD8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Flrt1Q6RKD8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Flrt1Q6RKD8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Flrt1Q6RKD8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Flrt1Q6RKD8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Flrt1Q6RKD8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Flrt1Q6RKD8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Flrt1Q6RKD8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Flrt1Q6RKD8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Flrt1Q6RKD8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Flrt1Q6RKD8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Flrt1Q6RKD8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Flrt1Q6RKD8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Flrt1Q6RKD8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Flrt1Q6RKD8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Flrt1Q6RKD8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Flrt1Q6RKD8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Flrt1Q6RKD8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Flrt1Q6RKD8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Flrt1Q6RKD8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Flrt1Q6RKD8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Flrt1Q6RKD8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Flrt1Q6RKD8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Flrt1Q6RKD8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Flrt1Q6RKD8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Flrt1Q6RKD8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Flrt1Q6RKD8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Flrt1Q6RKD8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Flrt1Q6RKD8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Flrt1Q6RKD8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Flrt1Q6RKD8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Flrt1Q6RKD8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Flrt1Q6RKD8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms