Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SvoplQ6PDF3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SvoplQ6PDF3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SvoplQ6PDF3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SvoplQ6PDF3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SvoplQ6PDF3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SvoplQ6PDF3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SvoplQ6PDF3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SvoplQ6PDF3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SvoplQ6PDF3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SvoplQ6PDF3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SvoplQ6PDF3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SvoplQ6PDF3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SvoplQ6PDF3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SvoplQ6PDF3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SvoplQ6PDF3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SvoplQ6PDF3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SvoplQ6PDF3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SvoplQ6PDF3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SvoplQ6PDF3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SvoplQ6PDF3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SvoplQ6PDF3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SvoplQ6PDF3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SvoplQ6PDF3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SvoplQ6PDF3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SvoplQ6PDF3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SvoplQ6PDF3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SvoplQ6PDF3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SvoplQ6PDF3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SvoplQ6PDF3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SvoplQ6PDF3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SvoplQ6PDF3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SvoplQ6PDF3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SvoplQ6PDF3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SvoplQ6PDF3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SvoplQ6PDF3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SvoplQ6PDF3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SvoplQ6PDF3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SvoplQ6PDF3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SvoplQ6PDF3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SvoplQ6PDF3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SvoplQ6PDF3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SvoplQ6PDF3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SvoplQ6PDF3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SvoplQ6PDF3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SvoplQ6PDF3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SvoplQ6PDF3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SvoplQ6PDF3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SvoplQ6PDF3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SvoplQ6PDF3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SvoplQ6PDF3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SvoplQ6PDF3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SvoplQ6PDF3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SvoplQ6PDF3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SvoplQ6PDF3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SvoplQ6PDF3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SvoplQ6PDF3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SvoplQ6PDF3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SvoplQ6PDF3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SvoplQ6PDF3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SvoplQ6PDF3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SvoplQ6PDF3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SvoplQ6PDF3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SvoplQ6PDF3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SvoplQ6PDF3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SvoplQ6PDF3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SvoplQ6PDF3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SvoplQ6PDF3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SvoplQ6PDF3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SvoplQ6PDF3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SvoplQ6PDF3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SvoplQ6PDF3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SvoplQ6PDF3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SvoplQ6PDF3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SvoplQ6PDF3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SvoplQ6PDF3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SvoplQ6PDF3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SvoplQ6PDF3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SvoplQ6PDF3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SvoplQ6PDF3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SvoplQ6PDF3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SvoplQ6PDF3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SvoplQ6PDF3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SvoplQ6PDF3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SvoplQ6PDF3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SvoplQ6PDF3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SvoplQ6PDF3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SvoplQ6PDF3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SvoplQ6PDF3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SvoplQ6PDF3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SvoplQ6PDF3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SvoplQ6PDF3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SvoplQ6PDF3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SvoplQ6PDF3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SvoplQ6PDF3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SvoplQ6PDF3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SvoplQ6PDF3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SvoplQ6PDF3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SvoplQ6PDF3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SvoplQ6PDF3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms