Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp49Q6P9L4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp49Q6P9L4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp49Q6P9L4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp49Q6P9L4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp49Q6P9L4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp49Q6P9L4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp49Q6P9L4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp49Q6P9L4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp49Q6P9L4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp49Q6P9L4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp49Q6P9L4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp49Q6P9L4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp49Q6P9L4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp49Q6P9L4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp49Q6P9L4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp49Q6P9L4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp49Q6P9L4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp49Q6P9L4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp49Q6P9L4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp49Q6P9L4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp49Q6P9L4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp49Q6P9L4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp49Q6P9L4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp49Q6P9L4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp49Q6P9L4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp49Q6P9L4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp49Q6P9L4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp49Q6P9L4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp49Q6P9L4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Usp49Q6P9L4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp49Q6P9L4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp49Q6P9L4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp49Q6P9L4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp49Q6P9L4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp49Q6P9L4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp49Q6P9L4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp49Q6P9L4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp49Q6P9L4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp49Q6P9L4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp49Q6P9L4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp49Q6P9L4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp49Q6P9L4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp49Q6P9L4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp49Q6P9L4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp49Q6P9L4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp49Q6P9L4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp49Q6P9L4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp49Q6P9L4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp49Q6P9L4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp49Q6P9L4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp49Q6P9L4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp49Q6P9L4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp49Q6P9L4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp49Q6P9L4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp49Q6P9L4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp49Q6P9L4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp49Q6P9L4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp49Q6P9L4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp49Q6P9L4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp49Q6P9L4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp49Q6P9L4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp49Q6P9L4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp49Q6P9L4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp49Q6P9L4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp49Q6P9L4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp49Q6P9L4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp49Q6P9L4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp49Q6P9L4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp49Q6P9L4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp49Q6P9L4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp49Q6P9L4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp49Q6P9L4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp49Q6P9L4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp49Q6P9L4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp49Q6P9L4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp49Q6P9L4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp49Q6P9L4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp49Q6P9L4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp49Q6P9L4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp49Q6P9L4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp49Q6P9L4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp49Q6P9L4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp49Q6P9L4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp49Q6P9L4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp49Q6P9L4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp49Q6P9L4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp49Q6P9L4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp49Q6P9L4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp49Q6P9L4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp49Q6P9L4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp49Q6P9L4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp49Q6P9L4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp49Q6P9L4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp49Q6P9L4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp49Q6P9L4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp49Q6P9L4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp49Q6P9L4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp49Q6P9L4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp49Q6P9L4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms