Protein–RNA interactions for Protein: Q6P542

Abcf1, ATP-binding cassette sub-family F member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf1Q6P542 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Abcf1Q6P542 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcf1Q6P542 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcf1Q6P542 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcf1Q6P542 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcf1Q6P542 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Abcf1Q6P542 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Abcf1Q6P542 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Abcf1Q6P542 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcf1Q6P542 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcf1Q6P542 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcf1Q6P542 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcf1Q6P542 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcf1Q6P542 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcf1Q6P542 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcf1Q6P542 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcf1Q6P542 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcf1Q6P542 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcf1Q6P542 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcf1Q6P542 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcf1Q6P542 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcf1Q6P542 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcf1Q6P542 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcf1Q6P542 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcf1Q6P542 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcf1Q6P542 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcf1Q6P542 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcf1Q6P542 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcf1Q6P542 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcf1Q6P542 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcf1Q6P542 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcf1Q6P542 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcf1Q6P542 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcf1Q6P542 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcf1Q6P542 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcf1Q6P542 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcf1Q6P542 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcf1Q6P542 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcf1Q6P542 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcf1Q6P542 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Abcf1Q6P542 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Abcf1Q6P542 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Abcf1Q6P542 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Abcf1Q6P542 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Abcf1Q6P542 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Abcf1Q6P542 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Abcf1Q6P542 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcf1Q6P542 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcf1Q6P542 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcf1Q6P542 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcf1Q6P542 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcf1Q6P542 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcf1Q6P542 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcf1Q6P542 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcf1Q6P542 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcf1Q6P542 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcf1Q6P542 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcf1Q6P542 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcf1Q6P542 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcf1Q6P542 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcf1Q6P542 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcf1Q6P542 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcf1Q6P542 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcf1Q6P542 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcf1Q6P542 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcf1Q6P542 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcf1Q6P542 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcf1Q6P542 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Abcf1Q6P542 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcf1Q6P542 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
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