Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NipblQ6KCD5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NipblQ6KCD5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NipblQ6KCD5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NipblQ6KCD5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NipblQ6KCD5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NipblQ6KCD5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NipblQ6KCD5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NipblQ6KCD5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NipblQ6KCD5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NipblQ6KCD5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NipblQ6KCD5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NipblQ6KCD5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NipblQ6KCD5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NipblQ6KCD5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NipblQ6KCD5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NipblQ6KCD5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NipblQ6KCD5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NipblQ6KCD5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NipblQ6KCD5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NipblQ6KCD5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NipblQ6KCD5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NipblQ6KCD5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NipblQ6KCD5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NipblQ6KCD5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NipblQ6KCD5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NipblQ6KCD5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms