Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pram1Q6BCL1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pram1Q6BCL1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pram1Q6BCL1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pram1Q6BCL1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pram1Q6BCL1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pram1Q6BCL1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pram1Q6BCL1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Pram1Q6BCL1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Pram1Q6BCL1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pram1Q6BCL1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pram1Q6BCL1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Pram1Q6BCL1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Pram1Q6BCL1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pram1Q6BCL1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pram1Q6BCL1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pram1Q6BCL1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pram1Q6BCL1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pram1Q6BCL1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pram1Q6BCL1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pram1Q6BCL1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pram1Q6BCL1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pram1Q6BCL1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pram1Q6BCL1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pram1Q6BCL1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pram1Q6BCL1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pram1Q6BCL1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pram1Q6BCL1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pram1Q6BCL1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pram1Q6BCL1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pram1Q6BCL1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pram1Q6BCL1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pram1Q6BCL1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pram1Q6BCL1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pram1Q6BCL1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pram1Q6BCL1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pram1Q6BCL1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pram1Q6BCL1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pram1Q6BCL1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pram1Q6BCL1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pram1Q6BCL1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pram1Q6BCL1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pram1Q6BCL1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pram1Q6BCL1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pram1Q6BCL1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Pram1Q6BCL1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pram1Q6BCL1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pram1Q6BCL1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pram1Q6BCL1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pram1Q6BCL1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pram1Q6BCL1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pram1Q6BCL1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pram1Q6BCL1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pram1Q6BCL1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pram1Q6BCL1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pram1Q6BCL1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pram1Q6BCL1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pram1Q6BCL1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Pram1Q6BCL1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Pram1Q6BCL1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pram1Q6BCL1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pram1Q6BCL1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pram1Q6BCL1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pram1Q6BCL1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pram1Q6BCL1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pram1Q6BCL1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Pram1Q6BCL1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Pram1Q6BCL1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pram1Q6BCL1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pram1Q6BCL1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pram1Q6BCL1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Pram1Q6BCL1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pram1Q6BCL1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pram1Q6BCL1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pram1Q6BCL1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Pram1Q6BCL1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Pram1Q6BCL1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pram1Q6BCL1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pram1Q6BCL1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pram1Q6BCL1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Pram1Q6BCL1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pram1Q6BCL1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pram1Q6BCL1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Pram1Q6BCL1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Pram1Q6BCL1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Pram1Q6BCL1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pram1Q6BCL1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Pram1Q6BCL1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Pram1Q6BCL1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pram1Q6BCL1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Pram1Q6BCL1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pram1Q6BCL1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Pram1Q6BCL1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pram1Q6BCL1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pram1Q6BCL1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pram1Q6BCL1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pram1Q6BCL1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pram1Q6BCL1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pram1Q6BCL1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pram1Q6BCL1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms