Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Znf280dQ68FE8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Znf280dQ68FE8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Znf280dQ68FE8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Znf280dQ68FE8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Znf280dQ68FE8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Znf280dQ68FE8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Znf280dQ68FE8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Znf280dQ68FE8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Znf280dQ68FE8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Znf280dQ68FE8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Znf280dQ68FE8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Znf280dQ68FE8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Znf280dQ68FE8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znf280dQ68FE8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znf280dQ68FE8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Znf280dQ68FE8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Znf280dQ68FE8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Znf280dQ68FE8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znf280dQ68FE8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znf280dQ68FE8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znf280dQ68FE8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znf280dQ68FE8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Znf280dQ68FE8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Znf280dQ68FE8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Znf280dQ68FE8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Znf280dQ68FE8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Znf280dQ68FE8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Znf280dQ68FE8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Znf280dQ68FE8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Znf280dQ68FE8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Znf280dQ68FE8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Znf280dQ68FE8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Znf280dQ68FE8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Znf280dQ68FE8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Znf280dQ68FE8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Znf280dQ68FE8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Znf280dQ68FE8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Znf280dQ68FE8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Znf280dQ68FE8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Znf280dQ68FE8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Znf280dQ68FE8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Znf280dQ68FE8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Znf280dQ68FE8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Znf280dQ68FE8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Znf280dQ68FE8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Znf280dQ68FE8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Znf280dQ68FE8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf280dQ68FE8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf280dQ68FE8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Znf280dQ68FE8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Znf280dQ68FE8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Znf280dQ68FE8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Znf280dQ68FE8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Znf280dQ68FE8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Znf280dQ68FE8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Znf280dQ68FE8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Znf280dQ68FE8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Znf280dQ68FE8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Znf280dQ68FE8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf280dQ68FE8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf280dQ68FE8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf280dQ68FE8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf280dQ68FE8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf280dQ68FE8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf280dQ68FE8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf280dQ68FE8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf280dQ68FE8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf280dQ68FE8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf280dQ68FE8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf280dQ68FE8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf280dQ68FE8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf280dQ68FE8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf280dQ68FE8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf280dQ68FE8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf280dQ68FE8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf280dQ68FE8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf280dQ68FE8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf280dQ68FE8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf280dQ68FE8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf280dQ68FE8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf280dQ68FE8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf280dQ68FE8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf280dQ68FE8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf280dQ68FE8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf280dQ68FE8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf280dQ68FE8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf280dQ68FE8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf280dQ68FE8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf280dQ68FE8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf280dQ68FE8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf280dQ68FE8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf280dQ68FE8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf280dQ68FE8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf280dQ68FE8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf280dQ68FE8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf280dQ68FE8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Znf280dQ68FE8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Znf280dQ68FE8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Znf280dQ68FE8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms