Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nlrp9bQ66X22 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nlrp9bQ66X22 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Nlrp9bQ66X22 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nlrp9bQ66X22 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nlrp9bQ66X22 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Nlrp9bQ66X22 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nlrp9bQ66X22 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Nlrp9bQ66X22 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nlrp9bQ66X22 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nlrp9bQ66X22 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nlrp9bQ66X22 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nlrp9bQ66X22 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Nlrp9bQ66X22 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nlrp9bQ66X22 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nlrp9bQ66X22 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nlrp9bQ66X22 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nlrp9bQ66X22 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Nlrp9bQ66X22 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nlrp9bQ66X22 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nlrp9bQ66X22 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nlrp9bQ66X22 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nlrp9bQ66X22 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nlrp9bQ66X22 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nlrp9bQ66X22 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nlrp9bQ66X22 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Nlrp9bQ66X22 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Nlrp9bQ66X22 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nlrp9bQ66X22 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nlrp9bQ66X22 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nlrp9bQ66X22 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Nlrp9bQ66X22 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nlrp9bQ66X22 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Nlrp9bQ66X22 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nlrp9bQ66X22 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nlrp9bQ66X22 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nlrp9bQ66X22 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nlrp9bQ66X22 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nlrp9bQ66X22 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nlrp9bQ66X22 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nlrp9bQ66X22 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Nlrp9bQ66X22 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nlrp9bQ66X22 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Nlrp9bQ66X22 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nlrp9bQ66X22 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nlrp9bQ66X22 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nlrp9bQ66X22 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nlrp9bQ66X22 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nlrp9bQ66X22 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nlrp9bQ66X22 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nlrp9bQ66X22 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nlrp9bQ66X22 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nlrp9bQ66X22 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Nlrp9bQ66X22 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nlrp9bQ66X22 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nlrp9bQ66X22 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nlrp9bQ66X22 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nlrp9bQ66X22 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Nlrp9bQ66X22 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Nlrp9bQ66X22 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nlrp9bQ66X22 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Nlrp9bQ66X22 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Nlrp9bQ66X22 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nlrp9bQ66X22 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nlrp9bQ66X22 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nlrp9bQ66X22 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nlrp9bQ66X22 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nlrp9bQ66X22 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nlrp9bQ66X22 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms