Protein–RNA interactions for Protein: Q64FW2

Retsat, All-trans-retinol 13,14-reductase, mousemouse

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetsatQ64FW2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RetsatQ64FW2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RetsatQ64FW2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RetsatQ64FW2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RetsatQ64FW2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RetsatQ64FW2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RetsatQ64FW2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RetsatQ64FW2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RetsatQ64FW2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RetsatQ64FW2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RetsatQ64FW2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RetsatQ64FW2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RetsatQ64FW2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RetsatQ64FW2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RetsatQ64FW2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RetsatQ64FW2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RetsatQ64FW2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RetsatQ64FW2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RetsatQ64FW2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RetsatQ64FW2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RetsatQ64FW2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RetsatQ64FW2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RetsatQ64FW2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RetsatQ64FW2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RetsatQ64FW2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RetsatQ64FW2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RetsatQ64FW2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RetsatQ64FW2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RetsatQ64FW2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RetsatQ64FW2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RetsatQ64FW2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RetsatQ64FW2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RetsatQ64FW2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RetsatQ64FW2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RetsatQ64FW2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RetsatQ64FW2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RetsatQ64FW2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RetsatQ64FW2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RetsatQ64FW2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RetsatQ64FW2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RetsatQ64FW2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RetsatQ64FW2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RetsatQ64FW2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RetsatQ64FW2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RetsatQ64FW2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RetsatQ64FW2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RetsatQ64FW2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RetsatQ64FW2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RetsatQ64FW2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RetsatQ64FW2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RetsatQ64FW2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RetsatQ64FW2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RetsatQ64FW2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RetsatQ64FW2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RetsatQ64FW2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RetsatQ64FW2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RetsatQ64FW2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RetsatQ64FW2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RetsatQ64FW2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RetsatQ64FW2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RetsatQ64FW2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RetsatQ64FW2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RetsatQ64FW2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RetsatQ64FW2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RetsatQ64FW2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RetsatQ64FW2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RetsatQ64FW2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RetsatQ64FW2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RetsatQ64FW2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RetsatQ64FW2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RetsatQ64FW2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RetsatQ64FW2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RetsatQ64FW2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RetsatQ64FW2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RetsatQ64FW2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RetsatQ64FW2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RetsatQ64FW2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RetsatQ64FW2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RetsatQ64FW2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RetsatQ64FW2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RetsatQ64FW2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RetsatQ64FW2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RetsatQ64FW2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RetsatQ64FW2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RetsatQ64FW2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RetsatQ64FW2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RetsatQ64FW2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RetsatQ64FW2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
RetsatQ64FW2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RetsatQ64FW2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RetsatQ64FW2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RetsatQ64FW2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RetsatQ64FW2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RetsatQ64FW2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RetsatQ64FW2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RetsatQ64FW2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RetsatQ64FW2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RetsatQ64FW2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RetsatQ64FW2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RetsatQ64FW2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms