Protein–RNA interactions for Protein: Q64008

Rab34, Ras-related protein Rab-34, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab34Q64008 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab34Q64008 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab34Q64008 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab34Q64008 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab34Q64008 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab34Q64008 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab34Q64008 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab34Q64008 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab34Q64008 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab34Q64008 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab34Q64008 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab34Q64008 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab34Q64008 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab34Q64008 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab34Q64008 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab34Q64008 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab34Q64008 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rab34Q64008 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab34Q64008 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab34Q64008 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab34Q64008 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab34Q64008 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab34Q64008 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab34Q64008 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab34Q64008 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab34Q64008 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab34Q64008 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab34Q64008 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab34Q64008 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab34Q64008 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab34Q64008 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab34Q64008 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab34Q64008 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab34Q64008 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab34Q64008 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab34Q64008 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab34Q64008 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab34Q64008 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab34Q64008 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab34Q64008 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab34Q64008 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rab34Q64008 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab34Q64008 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab34Q64008 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab34Q64008 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab34Q64008 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab34Q64008 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab34Q64008 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab34Q64008 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab34Q64008 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab34Q64008 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab34Q64008 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab34Q64008 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab34Q64008 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab34Q64008 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab34Q64008 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab34Q64008 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab34Q64008 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab34Q64008 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab34Q64008 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab34Q64008 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab34Q64008 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab34Q64008 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rab34Q64008 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rab34Q64008 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab34Q64008 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab34Q64008 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab34Q64008 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab34Q64008 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms