Protein–RNA interactions for Protein: Q62481

Vps72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps72Q62481 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps72Q62481 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps72Q62481 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps72Q62481 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps72Q62481 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps72Q62481 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps72Q62481 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps72Q62481 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps72Q62481 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps72Q62481 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps72Q62481 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps72Q62481 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps72Q62481 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vps72Q62481 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vps72Q62481 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vps72Q62481 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vps72Q62481 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps72Q62481 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps72Q62481 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps72Q62481 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps72Q62481 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps72Q62481 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps72Q62481 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps72Q62481 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps72Q62481 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps72Q62481 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps72Q62481 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps72Q62481 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps72Q62481 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps72Q62481 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps72Q62481 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps72Q62481 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps72Q62481 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps72Q62481 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps72Q62481 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps72Q62481 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps72Q62481 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps72Q62481 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps72Q62481 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps72Q62481 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps72Q62481 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps72Q62481 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps72Q62481 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps72Q62481 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps72Q62481 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps72Q62481 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps72Q62481 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps72Q62481 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps72Q62481 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps72Q62481 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps72Q62481 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps72Q62481 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps72Q62481 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps72Q62481 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps72Q62481 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Vps72Q62481 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Vps72Q62481 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Vps72Q62481 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Vps72Q62481 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps72Q62481 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps72Q62481 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps72Q62481 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps72Q62481 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps72Q62481 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps72Q62481 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps72Q62481 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps72Q62481 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps72Q62481 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps72Q62481 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps72Q62481 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps72Q62481 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps72Q62481 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps72Q62481 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps72Q62481 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps72Q62481 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps72Q62481 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps72Q62481 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps72Q62481 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps72Q62481 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps72Q62481 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps72Q62481 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps72Q62481 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps72Q62481 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps72Q62481 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps72Q62481 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps72Q62481 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps72Q62481 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps72Q62481 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps72Q62481 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps72Q62481 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps72Q62481 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps72Q62481 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps72Q62481 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps72Q62481 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps72Q62481 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps72Q62481 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps72Q62481 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps72Q62481 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps72Q62481 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps72Q62481 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms