Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl12Q62401 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl12Q62401 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl12Q62401 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl12Q62401 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl12Q62401 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl12Q62401 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl12Q62401 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl12Q62401 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl12Q62401 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl12Q62401 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl12Q62401 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl12Q62401 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl12Q62401 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl12Q62401 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl12Q62401 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl12Q62401 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl12Q62401 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl12Q62401 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl12Q62401 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl12Q62401 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl12Q62401 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl12Q62401 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl12Q62401 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl12Q62401 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl12Q62401 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl12Q62401 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl12Q62401 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl12Q62401 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl12Q62401 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl12Q62401 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl12Q62401 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl12Q62401 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl12Q62401 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl12Q62401 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccl12Q62401 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl12Q62401 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl12Q62401 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl12Q62401 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl12Q62401 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl12Q62401 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl12Q62401 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl12Q62401 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl12Q62401 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl12Q62401 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl12Q62401 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl12Q62401 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl12Q62401 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl12Q62401 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl12Q62401 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl12Q62401 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl12Q62401 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl12Q62401 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl12Q62401 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl12Q62401 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl12Q62401 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl12Q62401 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl12Q62401 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl12Q62401 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl12Q62401 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl12Q62401 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl12Q62401 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl12Q62401 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl12Q62401 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl12Q62401 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl12Q62401 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl12Q62401 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl12Q62401 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl12Q62401 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl12Q62401 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl12Q62401 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl12Q62401 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl12Q62401 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl12Q62401 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl12Q62401 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl12Q62401 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl12Q62401 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl12Q62401 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl12Q62401 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl12Q62401 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl12Q62401 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl12Q62401 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl12Q62401 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms