Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC45.01■■■■■ 4.8
Kdm5dQ62240 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
Kdm5dQ62240 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC45■■■■■ 4.79
Kdm5dQ62240 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
Kdm5dQ62240 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC44.99■■■■■ 4.79
Kdm5dQ62240 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC44.99■■■■■ 4.79
Kdm5dQ62240 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC44.97■■■■■ 4.79
Kdm5dQ62240 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
Kdm5dQ62240 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.96■■■■■ 4.79
Kdm5dQ62240 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
Kdm5dQ62240 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
Kdm5dQ62240 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC44.95■■■■■ 4.79
Kdm5dQ62240 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC44.95■■■■■ 4.79
Kdm5dQ62240 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
Kdm5dQ62240 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
Kdm5dQ62240 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
Kdm5dQ62240 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC44.92■■■■■ 4.78
Kdm5dQ62240 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
Kdm5dQ62240 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
Kdm5dQ62240 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC44.91■■■■■ 4.78
Kdm5dQ62240 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
Kdm5dQ62240 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
Kdm5dQ62240 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
Kdm5dQ62240 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
Kdm5dQ62240 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
Kdm5dQ62240 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC44.89■■■■■ 4.78
Kdm5dQ62240 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC44.88■■■■■ 4.78
Kdm5dQ62240 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.77
Kdm5dQ62240 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.87■■■■■ 4.77
Kdm5dQ62240 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
Kdm5dQ62240 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC44.85■■■■■ 4.77
Kdm5dQ62240 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
Kdm5dQ62240 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
Kdm5dQ62240 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
Kdm5dQ62240 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
Kdm5dQ62240 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
Kdm5dQ62240 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.82■■■■■ 4.77
Kdm5dQ62240 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
Kdm5dQ62240 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC44.82■■■■■ 4.77
Kdm5dQ62240 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
Kdm5dQ62240 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
Kdm5dQ62240 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC44.8■■■■■ 4.76
Kdm5dQ62240 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
Kdm5dQ62240 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.8■■■■■ 4.76
Kdm5dQ62240 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
Kdm5dQ62240 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
Kdm5dQ62240 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC44.79■■■■■ 4.76
Kdm5dQ62240 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
Kdm5dQ62240 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
Kdm5dQ62240 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
Kdm5dQ62240 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
Kdm5dQ62240 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
Kdm5dQ62240 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
Kdm5dQ62240 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.76
Kdm5dQ62240 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.76
Kdm5dQ62240 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC44.74■■■■■ 4.75
Kdm5dQ62240 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
Kdm5dQ62240 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
Kdm5dQ62240 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
Kdm5dQ62240 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
Kdm5dQ62240 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Kdm5dQ62240 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.7■■■■■ 4.75
Kdm5dQ62240 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Kdm5dQ62240 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Kdm5dQ62240 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
Kdm5dQ62240 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
Kdm5dQ62240 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC44.69■■■■■ 4.74
Kdm5dQ62240 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC44.68■■■■■ 4.74
Kdm5dQ62240 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC44.67■■■■■ 4.74
Kdm5dQ62240 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.67■■■■■ 4.74
Kdm5dQ62240 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
Kdm5dQ62240 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
Kdm5dQ62240 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.66■■■■■ 4.74
Kdm5dQ62240 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
Kdm5dQ62240 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC44.65■■■■■ 4.74
Kdm5dQ62240 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC44.65■■■■■ 4.74
Kdm5dQ62240 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
Kdm5dQ62240 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
Kdm5dQ62240 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
Kdm5dQ62240 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC44.62■■■■■ 4.73
Kdm5dQ62240 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC44.62■■■■■ 4.73
Kdm5dQ62240 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
Kdm5dQ62240 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
Kdm5dQ62240 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC44.6■■■■■ 4.73
Kdm5dQ62240 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
Kdm5dQ62240 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
Kdm5dQ62240 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
Kdm5dQ62240 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC44.57■■■■■ 4.73
Kdm5dQ62240 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Kdm5dQ62240 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Kdm5dQ62240 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
Kdm5dQ62240 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
Kdm5dQ62240 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC44.53■■■■■ 4.72
Kdm5dQ62240 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
Kdm5dQ62240 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
Kdm5dQ62240 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
Kdm5dQ62240 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
Kdm5dQ62240 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
Kdm5dQ62240 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.5■■■■■ 4.71
Kdm5dQ62240 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms