Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RhocQ62159 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RhocQ62159 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RhocQ62159 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RhocQ62159 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RhocQ62159 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RhocQ62159 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RhocQ62159 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RhocQ62159 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RhocQ62159 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RhocQ62159 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RhocQ62159 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RhocQ62159 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RhocQ62159 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RhocQ62159 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RhocQ62159 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RhocQ62159 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RhocQ62159 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RhocQ62159 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RhocQ62159 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RhocQ62159 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RhocQ62159 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RhocQ62159 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RhocQ62159 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RhocQ62159 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RhocQ62159 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RhocQ62159 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RhocQ62159 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RhocQ62159 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RhocQ62159 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RhocQ62159 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RhocQ62159 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RhocQ62159 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RhocQ62159 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RhocQ62159 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RhocQ62159 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RhocQ62159 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RhocQ62159 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RhocQ62159 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RhocQ62159 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RhocQ62159 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RhocQ62159 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RhocQ62159 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RhocQ62159 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RhocQ62159 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RhocQ62159 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RhocQ62159 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RhocQ62159 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RhocQ62159 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RhocQ62159 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RhocQ62159 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RhocQ62159 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RhocQ62159 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RhocQ62159 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RhocQ62159 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RhocQ62159 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RhocQ62159 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RhocQ62159 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RhocQ62159 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RhocQ62159 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RhocQ62159 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RhocQ62159 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RhocQ62159 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RhocQ62159 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RhocQ62159 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RhocQ62159 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RhocQ62159 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RhocQ62159 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RhocQ62159 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RhocQ62159 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RhocQ62159 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RhocQ62159 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms