Protein–RNA interactions for Protein: Q61830

Mrc1, Macrophage mannose receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrc1Q61830 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mrc1Q61830 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mrc1Q61830 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mrc1Q61830 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mrc1Q61830 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mrc1Q61830 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mrc1Q61830 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mrc1Q61830 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mrc1Q61830 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mrc1Q61830 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mrc1Q61830 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mrc1Q61830 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mrc1Q61830 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Mrc1Q61830 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Mrc1Q61830 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mrc1Q61830 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mrc1Q61830 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mrc1Q61830 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mrc1Q61830 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mrc1Q61830 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mrc1Q61830 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mrc1Q61830 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mrc1Q61830 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Mrc1Q61830 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mrc1Q61830 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mrc1Q61830 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mrc1Q61830 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mrc1Q61830 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mrc1Q61830 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Mrc1Q61830 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Mrc1Q61830 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mrc1Q61830 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mrc1Q61830 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mrc1Q61830 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mrc1Q61830 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mrc1Q61830 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mrc1Q61830 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mrc1Q61830 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mrc1Q61830 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Mrc1Q61830 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Mrc1Q61830 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mrc1Q61830 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mrc1Q61830 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mrc1Q61830 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mrc1Q61830 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mrc1Q61830 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mrc1Q61830 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mrc1Q61830 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mrc1Q61830 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mrc1Q61830 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mrc1Q61830 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mrc1Q61830 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mrc1Q61830 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mrc1Q61830 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mrc1Q61830 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mrc1Q61830 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mrc1Q61830 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mrc1Q61830 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mrc1Q61830 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mrc1Q61830 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mrc1Q61830 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mrc1Q61830 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mrc1Q61830 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mrc1Q61830 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mrc1Q61830 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mrc1Q61830 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Mrc1Q61830 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mrc1Q61830 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mrc1Q61830 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Mrc1Q61830 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mrc1Q61830 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Mrc1Q61830 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mrc1Q61830 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mrc1Q61830 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mrc1Q61830 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mrc1Q61830 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mrc1Q61830 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Mrc1Q61830 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mrc1Q61830 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mrc1Q61830 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mrc1Q61830 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mrc1Q61830 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mrc1Q61830 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Mrc1Q61830 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mrc1Q61830 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mrc1Q61830 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mrc1Q61830 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mrc1Q61830 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mrc1Q61830 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mrc1Q61830 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mrc1Q61830 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mrc1Q61830 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mrc1Q61830 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Mrc1Q61830 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Mrc1Q61830 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Mrc1Q61830 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Mrc1Q61830 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Mrc1Q61830 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Mrc1Q61830 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mrc1Q61830 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms