Protein–RNA interactions for Protein: Q61711

Ibsp, Bone sialoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IbspQ61711 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IbspQ61711 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IbspQ61711 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IbspQ61711 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IbspQ61711 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IbspQ61711 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IbspQ61711 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IbspQ61711 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IbspQ61711 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IbspQ61711 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IbspQ61711 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IbspQ61711 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IbspQ61711 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
IbspQ61711 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IbspQ61711 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IbspQ61711 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IbspQ61711 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IbspQ61711 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IbspQ61711 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IbspQ61711 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IbspQ61711 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IbspQ61711 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IbspQ61711 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IbspQ61711 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IbspQ61711 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IbspQ61711 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IbspQ61711 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IbspQ61711 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IbspQ61711 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IbspQ61711 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IbspQ61711 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IbspQ61711 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IbspQ61711 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IbspQ61711 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IbspQ61711 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IbspQ61711 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IbspQ61711 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IbspQ61711 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IbspQ61711 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IbspQ61711 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IbspQ61711 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IbspQ61711 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IbspQ61711 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IbspQ61711 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IbspQ61711 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IbspQ61711 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IbspQ61711 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IbspQ61711 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IbspQ61711 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IbspQ61711 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IbspQ61711 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IbspQ61711 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IbspQ61711 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IbspQ61711 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IbspQ61711 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IbspQ61711 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IbspQ61711 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IbspQ61711 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IbspQ61711 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IbspQ61711 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IbspQ61711 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IbspQ61711 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IbspQ61711 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IbspQ61711 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IbspQ61711 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IbspQ61711 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IbspQ61711 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IbspQ61711 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IbspQ61711 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IbspQ61711 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IbspQ61711 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IbspQ61711 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IbspQ61711 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IbspQ61711 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IbspQ61711 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IbspQ61711 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IbspQ61711 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IbspQ61711 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IbspQ61711 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IbspQ61711 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IbspQ61711 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IbspQ61711 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IbspQ61711 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IbspQ61711 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IbspQ61711 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IbspQ61711 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IbspQ61711 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IbspQ61711 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IbspQ61711 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IbspQ61711 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IbspQ61711 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IbspQ61711 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IbspQ61711 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IbspQ61711 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IbspQ61711 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IbspQ61711 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IbspQ61711 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IbspQ61711 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IbspQ61711 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IbspQ61711 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms