Protein–RNA interactions for Protein: Q61663

Tlx2, T-cell leukemia homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx2Q61663 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlx2Q61663 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlx2Q61663 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlx2Q61663 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlx2Q61663 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tlx2Q61663 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlx2Q61663 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlx2Q61663 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tlx2Q61663 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tlx2Q61663 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tlx2Q61663 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlx2Q61663 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlx2Q61663 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlx2Q61663 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlx2Q61663 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlx2Q61663 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlx2Q61663 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlx2Q61663 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlx2Q61663 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlx2Q61663 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlx2Q61663 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tlx2Q61663 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlx2Q61663 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlx2Q61663 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tlx2Q61663 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlx2Q61663 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlx2Q61663 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlx2Q61663 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlx2Q61663 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlx2Q61663 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlx2Q61663 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlx2Q61663 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlx2Q61663 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlx2Q61663 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlx2Q61663 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlx2Q61663 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlx2Q61663 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlx2Q61663 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlx2Q61663 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlx2Q61663 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms