Protein–RNA interactions for Protein: Q61626

Grik5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik5Q61626 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Grik5Q61626 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Grik5Q61626 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Grik5Q61626 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Grik5Q61626 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Grik5Q61626 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Grik5Q61626 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Grik5Q61626 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Grik5Q61626 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Grik5Q61626 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Grik5Q61626 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Grik5Q61626 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Grik5Q61626 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Grik5Q61626 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Grik5Q61626 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Grik5Q61626 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Grik5Q61626 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Grik5Q61626 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Grik5Q61626 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Grik5Q61626 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Grik5Q61626 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Grik5Q61626 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Grik5Q61626 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Grik5Q61626 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Grik5Q61626 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Grik5Q61626 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Grik5Q61626 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Grik5Q61626 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Grik5Q61626 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Grik5Q61626 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Grik5Q61626 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Grik5Q61626 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Grik5Q61626 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Grik5Q61626 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Grik5Q61626 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Grik5Q61626 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Grik5Q61626 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Grik5Q61626 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Grik5Q61626 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Grik5Q61626 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Grik5Q61626 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Grik5Q61626 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Grik5Q61626 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Grik5Q61626 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Grik5Q61626 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Grik5Q61626 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Grik5Q61626 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Grik5Q61626 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Grik5Q61626 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Grik5Q61626 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Grik5Q61626 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Grik5Q61626 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Grik5Q61626 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Grik5Q61626 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Grik5Q61626 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Grik5Q61626 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Grik5Q61626 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Grik5Q61626 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Grik5Q61626 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Grik5Q61626 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Grik5Q61626 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Grik5Q61626 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Grik5Q61626 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Grik5Q61626 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Grik5Q61626 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Grik5Q61626 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Grik5Q61626 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Grik5Q61626 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Grik5Q61626 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Grik5Q61626 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Grik5Q61626 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Grik5Q61626 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms