Protein–RNA interactions for Protein: Q61184

Mtnr1a, Melatonin receptor type 1A, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnr1aQ61184 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtnr1aQ61184 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtnr1aQ61184 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtnr1aQ61184 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtnr1aQ61184 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtnr1aQ61184 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtnr1aQ61184 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtnr1aQ61184 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtnr1aQ61184 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtnr1aQ61184 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtnr1aQ61184 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtnr1aQ61184 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtnr1aQ61184 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtnr1aQ61184 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtnr1aQ61184 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtnr1aQ61184 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtnr1aQ61184 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtnr1aQ61184 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtnr1aQ61184 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtnr1aQ61184 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtnr1aQ61184 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtnr1aQ61184 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtnr1aQ61184 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtnr1aQ61184 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtnr1aQ61184 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtnr1aQ61184 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtnr1aQ61184 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtnr1aQ61184 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtnr1aQ61184 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtnr1aQ61184 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtnr1aQ61184 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtnr1aQ61184 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtnr1aQ61184 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtnr1aQ61184 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtnr1aQ61184 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtnr1aQ61184 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtnr1aQ61184 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtnr1aQ61184 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtnr1aQ61184 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtnr1aQ61184 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtnr1aQ61184 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtnr1aQ61184 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtnr1aQ61184 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtnr1aQ61184 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtnr1aQ61184 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mtnr1aQ61184 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mtnr1aQ61184 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Mtnr1aQ61184 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mtnr1aQ61184 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtnr1aQ61184 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtnr1aQ61184 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mtnr1aQ61184 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mtnr1aQ61184 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mtnr1aQ61184 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtnr1aQ61184 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtnr1aQ61184 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtnr1aQ61184 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtnr1aQ61184 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtnr1aQ61184 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mtnr1aQ61184 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mtnr1aQ61184 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mtnr1aQ61184 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Mtnr1aQ61184 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtnr1aQ61184 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtnr1aQ61184 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtnr1aQ61184 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtnr1aQ61184 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtnr1aQ61184 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtnr1aQ61184 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtnr1aQ61184 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtnr1aQ61184 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtnr1aQ61184 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtnr1aQ61184 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mtnr1aQ61184 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Mtnr1aQ61184 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mtnr1aQ61184 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mtnr1aQ61184 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mtnr1aQ61184 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mtnr1aQ61184 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mtnr1aQ61184 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mtnr1aQ61184 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mtnr1aQ61184 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mtnr1aQ61184 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mtnr1aQ61184 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mtnr1aQ61184 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mtnr1aQ61184 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mtnr1aQ61184 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Mtnr1aQ61184 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mtnr1aQ61184 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mtnr1aQ61184 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mtnr1aQ61184 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mtnr1aQ61184 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mtnr1aQ61184 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mtnr1aQ61184 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mtnr1aQ61184 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mtnr1aQ61184 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mtnr1aQ61184 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mtnr1aQ61184 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mtnr1aQ61184 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mtnr1aQ61184 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms