Protein–RNA interactions for Protein: Q61116

Znf235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf235Q61116 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf235Q61116 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf235Q61116 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf235Q61116 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf235Q61116 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf235Q61116 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf235Q61116 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf235Q61116 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf235Q61116 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf235Q61116 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf235Q61116 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf235Q61116 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf235Q61116 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf235Q61116 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf235Q61116 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf235Q61116 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf235Q61116 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Znf235Q61116 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf235Q61116 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf235Q61116 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf235Q61116 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf235Q61116 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf235Q61116 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf235Q61116 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf235Q61116 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf235Q61116 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf235Q61116 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf235Q61116 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf235Q61116 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf235Q61116 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf235Q61116 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf235Q61116 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf235Q61116 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf235Q61116 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf235Q61116 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf235Q61116 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf235Q61116 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf235Q61116 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf235Q61116 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf235Q61116 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf235Q61116 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf235Q61116 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf235Q61116 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf235Q61116 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Znf235Q61116 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf235Q61116 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf235Q61116 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf235Q61116 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf235Q61116 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf235Q61116 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf235Q61116 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf235Q61116 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf235Q61116 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf235Q61116 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf235Q61116 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf235Q61116 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf235Q61116 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf235Q61116 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf235Q61116 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf235Q61116 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf235Q61116 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf235Q61116 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf235Q61116 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf235Q61116 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf235Q61116 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf235Q61116 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf235Q61116 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf235Q61116 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms