Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gbp4Q61107 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbp4Q61107 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gbp4Q61107 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gbp4Q61107 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gbp4Q61107 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gbp4Q61107 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gbp4Q61107 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gbp4Q61107 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gbp4Q61107 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gbp4Q61107 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gbp4Q61107 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gbp4Q61107 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gbp4Q61107 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gbp4Q61107 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gbp4Q61107 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gbp4Q61107 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gbp4Q61107 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gbp4Q61107 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gbp4Q61107 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gbp4Q61107 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gbp4Q61107 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gbp4Q61107 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gbp4Q61107 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gbp4Q61107 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gbp4Q61107 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gbp4Q61107 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gbp4Q61107 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gbp4Q61107 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gbp4Q61107 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gbp4Q61107 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gbp4Q61107 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbp4Q61107 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbp4Q61107 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbp4Q61107 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gbp4Q61107 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gbp4Q61107 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gbp4Q61107 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gbp4Q61107 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gbp4Q61107 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gbp4Q61107 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gbp4Q61107 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gbp4Q61107 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp4Q61107 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbp4Q61107 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbp4Q61107 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbp4Q61107 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbp4Q61107 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbp4Q61107 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbp4Q61107 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbp4Q61107 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbp4Q61107 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbp4Q61107 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbp4Q61107 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp4Q61107 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp4Q61107 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp4Q61107 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp4Q61107 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp4Q61107 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp4Q61107 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp4Q61107 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp4Q61107 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp4Q61107 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp4Q61107 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp4Q61107 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp4Q61107 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp4Q61107 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp4Q61107 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gbp4Q61107 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms