Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc1Q61056 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trpc1Q61056 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc1Q61056 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc1Q61056 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc1Q61056 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc1Q61056 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc1Q61056 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc1Q61056 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc1Q61056 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc1Q61056 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc1Q61056 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc1Q61056 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc1Q61056 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc1Q61056 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc1Q61056 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc1Q61056 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc1Q61056 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc1Q61056 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc1Q61056 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc1Q61056 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc1Q61056 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc1Q61056 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc1Q61056 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc1Q61056 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc1Q61056 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc1Q61056 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc1Q61056 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc1Q61056 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc1Q61056 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc1Q61056 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc1Q61056 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc1Q61056 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc1Q61056 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc1Q61056 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc1Q61056 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc1Q61056 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc1Q61056 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc1Q61056 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc1Q61056 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc1Q61056 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc1Q61056 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc1Q61056 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc1Q61056 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc1Q61056 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc1Q61056 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc1Q61056 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc1Q61056 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc1Q61056 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc1Q61056 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc1Q61056 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc1Q61056 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc1Q61056 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc1Q61056 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc1Q61056 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc1Q61056 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpc1Q61056 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc1Q61056 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc1Q61056 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc1Q61056 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc1Q61056 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc1Q61056 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc1Q61056 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc1Q61056 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc1Q61056 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc1Q61056 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc1Q61056 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc1Q61056 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc1Q61056 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc1Q61056 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc1Q61056 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc1Q61056 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc1Q61056 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc1Q61056 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc1Q61056 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc1Q61056 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc1Q61056 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc1Q61056 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc1Q61056 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc1Q61056 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc1Q61056 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc1Q61056 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trpc1Q61056 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc1Q61056 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc1Q61056 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc1Q61056 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc1Q61056 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc1Q61056 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc1Q61056 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc1Q61056 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc1Q61056 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc1Q61056 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc1Q61056 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc1Q61056 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc1Q61056 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc1Q61056 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc1Q61056 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc1Q61056 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc1Q61056 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc1Q61056 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms