Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NinQ61043 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NinQ61043 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NinQ61043 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NinQ61043 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NinQ61043 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NinQ61043 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NinQ61043 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NinQ61043 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NinQ61043 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NinQ61043 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NinQ61043 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NinQ61043 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NinQ61043 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NinQ61043 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NinQ61043 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NinQ61043 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NinQ61043 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NinQ61043 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NinQ61043 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NinQ61043 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NinQ61043 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NinQ61043 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NinQ61043 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NinQ61043 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NinQ61043 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NinQ61043 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NinQ61043 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NinQ61043 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NinQ61043 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NinQ61043 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NinQ61043 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NinQ61043 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NinQ61043 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NinQ61043 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NinQ61043 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NinQ61043 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NinQ61043 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NinQ61043 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NinQ61043 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NinQ61043 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NinQ61043 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NinQ61043 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NinQ61043 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NinQ61043 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NinQ61043 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NinQ61043 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NinQ61043 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NinQ61043 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NinQ61043 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NinQ61043 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NinQ61043 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NinQ61043 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
NinQ61043 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
NinQ61043 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NinQ61043 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NinQ61043 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NinQ61043 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NinQ61043 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NinQ61043 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NinQ61043 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NinQ61043 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NinQ61043 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NinQ61043 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NinQ61043 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NinQ61043 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NinQ61043 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NinQ61043 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NinQ61043 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NinQ61043 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NinQ61043 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NinQ61043 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NinQ61043 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NinQ61043 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NinQ61043 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NinQ61043 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NinQ61043 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NinQ61043 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NinQ61043 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NinQ61043 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NinQ61043 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NinQ61043 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NinQ61043 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NinQ61043 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NinQ61043 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NinQ61043 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NinQ61043 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NinQ61043 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NinQ61043 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NinQ61043 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NinQ61043 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NinQ61043 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NinQ61043 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NinQ61043 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NinQ61043 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NinQ61043 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NinQ61043 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NinQ61043 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NinQ61043 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NinQ61043 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms