Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Samhd1Q60710 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Samhd1Q60710 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Samhd1Q60710 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Samhd1Q60710 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Samhd1Q60710 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Samhd1Q60710 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Samhd1Q60710 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Samhd1Q60710 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Samhd1Q60710 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Samhd1Q60710 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Samhd1Q60710 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Samhd1Q60710 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Samhd1Q60710 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Samhd1Q60710 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Samhd1Q60710 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Samhd1Q60710 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Samhd1Q60710 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Samhd1Q60710 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Samhd1Q60710 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Samhd1Q60710 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Samhd1Q60710 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Samhd1Q60710 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Samhd1Q60710 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Samhd1Q60710 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Samhd1Q60710 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Samhd1Q60710 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Samhd1Q60710 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Samhd1Q60710 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Samhd1Q60710 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Samhd1Q60710 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Samhd1Q60710 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Samhd1Q60710 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Samhd1Q60710 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Samhd1Q60710 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Samhd1Q60710 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Samhd1Q60710 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Samhd1Q60710 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Samhd1Q60710 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Samhd1Q60710 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Samhd1Q60710 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Samhd1Q60710 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Samhd1Q60710 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Samhd1Q60710 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Samhd1Q60710 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Samhd1Q60710 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Samhd1Q60710 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Samhd1Q60710 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Samhd1Q60710 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Samhd1Q60710 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Samhd1Q60710 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Samhd1Q60710 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Samhd1Q60710 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Samhd1Q60710 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Samhd1Q60710 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Samhd1Q60710 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Samhd1Q60710 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Samhd1Q60710 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Samhd1Q60710 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Samhd1Q60710 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Samhd1Q60710 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Samhd1Q60710 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Samhd1Q60710 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Samhd1Q60710 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Samhd1Q60710 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Samhd1Q60710 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Samhd1Q60710 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Samhd1Q60710 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Samhd1Q60710 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Samhd1Q60710 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Samhd1Q60710 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Samhd1Q60710 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Samhd1Q60710 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Samhd1Q60710 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Samhd1Q60710 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Samhd1Q60710 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Samhd1Q60710 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Samhd1Q60710 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Samhd1Q60710 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Samhd1Q60710 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Samhd1Q60710 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Samhd1Q60710 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Samhd1Q60710 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Samhd1Q60710 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Samhd1Q60710 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Samhd1Q60710 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Samhd1Q60710 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Samhd1Q60710 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Samhd1Q60710 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Samhd1Q60710 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Samhd1Q60710 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Samhd1Q60710 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Samhd1Q60710 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Samhd1Q60710 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Samhd1Q60710 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Samhd1Q60710 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Samhd1Q60710 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Samhd1Q60710 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Samhd1Q60710 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Samhd1Q60710 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms