Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ItgaeQ60677 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ItgaeQ60677 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ItgaeQ60677 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ItgaeQ60677 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ItgaeQ60677 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ItgaeQ60677 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ItgaeQ60677 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ItgaeQ60677 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ItgaeQ60677 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ItgaeQ60677 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ItgaeQ60677 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ItgaeQ60677 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ItgaeQ60677 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ItgaeQ60677 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ItgaeQ60677 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ItgaeQ60677 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ItgaeQ60677 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ItgaeQ60677 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ItgaeQ60677 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ItgaeQ60677 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ItgaeQ60677 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ItgaeQ60677 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ItgaeQ60677 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ItgaeQ60677 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ItgaeQ60677 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ItgaeQ60677 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ItgaeQ60677 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ItgaeQ60677 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ItgaeQ60677 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ItgaeQ60677 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ItgaeQ60677 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ItgaeQ60677 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ItgaeQ60677 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ItgaeQ60677 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ItgaeQ60677 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ItgaeQ60677 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ItgaeQ60677 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ItgaeQ60677 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ItgaeQ60677 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ItgaeQ60677 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ItgaeQ60677 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ItgaeQ60677 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ItgaeQ60677 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ItgaeQ60677 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ItgaeQ60677 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ItgaeQ60677 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ItgaeQ60677 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ItgaeQ60677 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ItgaeQ60677 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ItgaeQ60677 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ItgaeQ60677 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ItgaeQ60677 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ItgaeQ60677 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ItgaeQ60677 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ItgaeQ60677 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ItgaeQ60677 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ItgaeQ60677 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ItgaeQ60677 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ItgaeQ60677 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ItgaeQ60677 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ItgaeQ60677 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ItgaeQ60677 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ItgaeQ60677 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ItgaeQ60677 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ItgaeQ60677 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ItgaeQ60677 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ItgaeQ60677 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ItgaeQ60677 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ItgaeQ60677 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ItgaeQ60677 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ItgaeQ60677 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ItgaeQ60677 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ItgaeQ60677 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ItgaeQ60677 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ItgaeQ60677 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ItgaeQ60677 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ItgaeQ60677 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ItgaeQ60677 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ItgaeQ60677 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ItgaeQ60677 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ItgaeQ60677 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ItgaeQ60677 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ItgaeQ60677 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ItgaeQ60677 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ItgaeQ60677 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ItgaeQ60677 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ItgaeQ60677 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ItgaeQ60677 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ItgaeQ60677 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ItgaeQ60677 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ItgaeQ60677 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ItgaeQ60677 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ItgaeQ60677 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ItgaeQ60677 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ItgaeQ60677 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ItgaeQ60677 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ItgaeQ60677 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ItgaeQ60677 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ItgaeQ60677 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms