Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc125Q5U465 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc125Q5U465 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc125Q5U465 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc125Q5U465 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc125Q5U465 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc125Q5U465 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc125Q5U465 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc125Q5U465 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc125Q5U465 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc125Q5U465 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc125Q5U465 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc125Q5U465 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc125Q5U465 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc125Q5U465 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc125Q5U465 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc125Q5U465 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc125Q5U465 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc125Q5U465 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc125Q5U465 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc125Q5U465 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc125Q5U465 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc125Q5U465 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc125Q5U465 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc125Q5U465 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc125Q5U465 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc125Q5U465 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc125Q5U465 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc125Q5U465 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc125Q5U465 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc125Q5U465 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc125Q5U465 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc125Q5U465 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc125Q5U465 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc125Q5U465 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc125Q5U465 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc125Q5U465 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc125Q5U465 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc125Q5U465 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc125Q5U465 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc125Q5U465 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc125Q5U465 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc125Q5U465 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc125Q5U465 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc125Q5U465 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc125Q5U465 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc125Q5U465 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc125Q5U465 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc125Q5U465 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc125Q5U465 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc125Q5U465 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc125Q5U465 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc125Q5U465 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc125Q5U465 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc125Q5U465 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc125Q5U465 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc125Q5U465 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc125Q5U465 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc125Q5U465 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc125Q5U465 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc125Q5U465 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc125Q5U465 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc125Q5U465 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc125Q5U465 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc125Q5U465 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc125Q5U465 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc125Q5U465 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc125Q5U465 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc125Q5U465 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc125Q5U465 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc125Q5U465 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc125Q5U465 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc125Q5U465 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc125Q5U465 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc125Q5U465 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc125Q5U465 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc125Q5U465 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc125Q5U465 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc125Q5U465 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc125Q5U465 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc125Q5U465 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc125Q5U465 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc125Q5U465 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc125Q5U465 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc125Q5U465 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc125Q5U465 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc125Q5U465 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc125Q5U465 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc125Q5U465 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc125Q5U465 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc125Q5U465 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc125Q5U465 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc125Q5U465 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc125Q5U465 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc125Q5U465 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc125Q5U465 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc125Q5U465 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc125Q5U465 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc125Q5U465 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc125Q5U465 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms