Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYD0

Myo1d, Unconventional myosin-Id, mousemouse

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1dQ5SYD0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myo1dQ5SYD0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myo1dQ5SYD0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myo1dQ5SYD0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myo1dQ5SYD0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myo1dQ5SYD0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myo1dQ5SYD0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myo1dQ5SYD0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myo1dQ5SYD0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Myo1dQ5SYD0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Myo1dQ5SYD0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myo1dQ5SYD0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myo1dQ5SYD0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myo1dQ5SYD0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myo1dQ5SYD0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myo1dQ5SYD0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myo1dQ5SYD0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myo1dQ5SYD0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myo1dQ5SYD0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myo1dQ5SYD0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myo1dQ5SYD0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myo1dQ5SYD0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myo1dQ5SYD0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Myo1dQ5SYD0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myo1dQ5SYD0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myo1dQ5SYD0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myo1dQ5SYD0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myo1dQ5SYD0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myo1dQ5SYD0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo1dQ5SYD0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo1dQ5SYD0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo1dQ5SYD0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo1dQ5SYD0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo1dQ5SYD0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo1dQ5SYD0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo1dQ5SYD0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo1dQ5SYD0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo1dQ5SYD0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo1dQ5SYD0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo1dQ5SYD0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo1dQ5SYD0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo1dQ5SYD0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo1dQ5SYD0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo1dQ5SYD0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo1dQ5SYD0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo1dQ5SYD0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo1dQ5SYD0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo1dQ5SYD0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo1dQ5SYD0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo1dQ5SYD0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo1dQ5SYD0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo1dQ5SYD0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo1dQ5SYD0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo1dQ5SYD0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo1dQ5SYD0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Myo1dQ5SYD0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myo1dQ5SYD0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Myo1dQ5SYD0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Myo1dQ5SYD0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myo1dQ5SYD0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myo1dQ5SYD0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myo1dQ5SYD0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myo1dQ5SYD0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myo1dQ5SYD0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo1dQ5SYD0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo1dQ5SYD0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo1dQ5SYD0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo1dQ5SYD0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Myo1dQ5SYD0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Myo1dQ5SYD0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Myo1dQ5SYD0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo1dQ5SYD0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms