Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tsr1Q5SWD9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tsr1Q5SWD9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsr1Q5SWD9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsr1Q5SWD9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsr1Q5SWD9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsr1Q5SWD9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsr1Q5SWD9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsr1Q5SWD9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsr1Q5SWD9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsr1Q5SWD9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsr1Q5SWD9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsr1Q5SWD9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsr1Q5SWD9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsr1Q5SWD9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsr1Q5SWD9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsr1Q5SWD9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsr1Q5SWD9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsr1Q5SWD9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsr1Q5SWD9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsr1Q5SWD9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsr1Q5SWD9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsr1Q5SWD9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsr1Q5SWD9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsr1Q5SWD9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tsr1Q5SWD9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tsr1Q5SWD9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tsr1Q5SWD9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tsr1Q5SWD9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsr1Q5SWD9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsr1Q5SWD9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsr1Q5SWD9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsr1Q5SWD9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsr1Q5SWD9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsr1Q5SWD9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsr1Q5SWD9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1552.9 ms