Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Tns3Q5SSZ5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Tns3Q5SSZ5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Tns3Q5SSZ5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Tns3Q5SSZ5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Tns3Q5SSZ5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Tns3Q5SSZ5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Tns3Q5SSZ5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Tns3Q5SSZ5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Tns3Q5SSZ5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Tns3Q5SSZ5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Tns3Q5SSZ5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Tns3Q5SSZ5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Tns3Q5SSZ5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Tns3Q5SSZ5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Tns3Q5SSZ5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Tns3Q5SSZ5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Tns3Q5SSZ5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Tns3Q5SSZ5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Tns3Q5SSZ5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Tns3Q5SSZ5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Tns3Q5SSZ5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Tns3Q5SSZ5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Tns3Q5SSZ5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Tns3Q5SSZ5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Tns3Q5SSZ5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Tns3Q5SSZ5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Tns3Q5SSZ5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Tns3Q5SSZ5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Tns3Q5SSZ5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Tns3Q5SSZ5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Tns3Q5SSZ5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Tns3Q5SSZ5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Tns3Q5SSZ5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Tns3Q5SSZ5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Tns3Q5SSZ5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Tns3Q5SSZ5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Tns3Q5SSZ5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Tns3Q5SSZ5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Tns3Q5SSZ5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tns3Q5SSZ5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tns3Q5SSZ5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tns3Q5SSZ5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tns3Q5SSZ5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Tns3Q5SSZ5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Tns3Q5SSZ5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Tns3Q5SSZ5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Tns3Q5SSZ5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Tns3Q5SSZ5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Tns3Q5SSZ5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Tns3Q5SSZ5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Tns3Q5SSZ5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Tns3Q5SSZ5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Tns3Q5SSZ5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Tns3Q5SSZ5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Tns3Q5SSZ5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Tns3Q5SSZ5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Tns3Q5SSZ5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Tns3Q5SSZ5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Tns3Q5SSZ5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Tns3Q5SSZ5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Tns3Q5SSZ5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Tns3Q5SSZ5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Tns3Q5SSZ5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Tns3Q5SSZ5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Tns3Q5SSZ5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Tns3Q5SSZ5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Tns3Q5SSZ5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Tns3Q5SSZ5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Tns3Q5SSZ5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tns3Q5SSZ5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Tns3Q5SSZ5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Tns3Q5SSZ5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Tns3Q5SSZ5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Tns3Q5SSZ5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Tns3Q5SSZ5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Tns3Q5SSZ5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Tns3Q5SSZ5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Tns3Q5SSZ5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Tns3Q5SSZ5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Tns3Q5SSZ5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Tns3Q5SSZ5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Tns3Q5SSZ5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Tns3Q5SSZ5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Tns3Q5SSZ5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Tns3Q5SSZ5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Tns3Q5SSZ5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Tns3Q5SSZ5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Tns3Q5SSZ5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Tns3Q5SSZ5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Tns3Q5SSZ5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Tns3Q5SSZ5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Tns3Q5SSZ5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Tns3Q5SSZ5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Tns3Q5SSZ5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Tns3Q5SSZ5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Tns3Q5SSZ5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Tns3Q5SSZ5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Tns3Q5SSZ5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Tns3Q5SSZ5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms