Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam46cQ5SSF7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam46cQ5SSF7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam46cQ5SSF7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam46cQ5SSF7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam46cQ5SSF7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam46cQ5SSF7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam46cQ5SSF7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam46cQ5SSF7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam46cQ5SSF7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam46cQ5SSF7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam46cQ5SSF7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam46cQ5SSF7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam46cQ5SSF7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam46cQ5SSF7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam46cQ5SSF7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam46cQ5SSF7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam46cQ5SSF7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam46cQ5SSF7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam46cQ5SSF7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam46cQ5SSF7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam46cQ5SSF7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam46cQ5SSF7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam46cQ5SSF7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam46cQ5SSF7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam46cQ5SSF7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam46cQ5SSF7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam46cQ5SSF7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam46cQ5SSF7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam46cQ5SSF7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam46cQ5SSF7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam46cQ5SSF7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam46cQ5SSF7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam46cQ5SSF7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam46cQ5SSF7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam46cQ5SSF7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam46cQ5SSF7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam46cQ5SSF7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam46cQ5SSF7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam46cQ5SSF7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam46cQ5SSF7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam46cQ5SSF7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam46cQ5SSF7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam46cQ5SSF7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam46cQ5SSF7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam46cQ5SSF7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam46cQ5SSF7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam46cQ5SSF7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam46cQ5SSF7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam46cQ5SSF7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam46cQ5SSF7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam46cQ5SSF7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam46cQ5SSF7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam46cQ5SSF7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam46cQ5SSF7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam46cQ5SSF7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam46cQ5SSF7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam46cQ5SSF7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam46cQ5SSF7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam46cQ5SSF7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam46cQ5SSF7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam46cQ5SSF7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam46cQ5SSF7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam46cQ5SSF7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam46cQ5SSF7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam46cQ5SSF7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam46cQ5SSF7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam46cQ5SSF7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam46cQ5SSF7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam46cQ5SSF7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam46cQ5SSF7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam46cQ5SSF7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam46cQ5SSF7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam46cQ5SSF7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam46cQ5SSF7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam46cQ5SSF7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam46cQ5SSF7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam46cQ5SSF7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam46cQ5SSF7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam46cQ5SSF7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam46cQ5SSF7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam46cQ5SSF7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam46cQ5SSF7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam46cQ5SSF7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam46cQ5SSF7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam46cQ5SSF7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam46cQ5SSF7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam46cQ5SSF7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam46cQ5SSF7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam46cQ5SSF7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam46cQ5SSF7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam46cQ5SSF7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam46cQ5SSF7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam46cQ5SSF7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam46cQ5SSF7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam46cQ5SSF7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam46cQ5SSF7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam46cQ5SSF7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam46cQ5SSF7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam46cQ5SSF7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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