Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phf12Q5SPL2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phf12Q5SPL2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phf12Q5SPL2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phf12Q5SPL2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phf12Q5SPL2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phf12Q5SPL2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phf12Q5SPL2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phf12Q5SPL2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf12Q5SPL2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf12Q5SPL2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf12Q5SPL2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf12Q5SPL2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf12Q5SPL2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf12Q5SPL2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf12Q5SPL2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf12Q5SPL2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf12Q5SPL2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf12Q5SPL2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf12Q5SPL2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phf12Q5SPL2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phf12Q5SPL2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf12Q5SPL2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Phf12Q5SPL2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf12Q5SPL2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf12Q5SPL2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf12Q5SPL2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf12Q5SPL2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf12Q5SPL2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phf12Q5SPL2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phf12Q5SPL2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf12Q5SPL2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf12Q5SPL2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf12Q5SPL2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf12Q5SPL2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf12Q5SPL2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf12Q5SPL2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phf12Q5SPL2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phf12Q5SPL2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phf12Q5SPL2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf12Q5SPL2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms