Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
1810065E05RikQ5NC41 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
1810065E05RikQ5NC41 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
1810065E05RikQ5NC41 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
1810065E05RikQ5NC41 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
1810065E05RikQ5NC41 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
1810065E05RikQ5NC41 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
1810065E05RikQ5NC41 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
1810065E05RikQ5NC41 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
1810065E05RikQ5NC41 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
1810065E05RikQ5NC41 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
1810065E05RikQ5NC41 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
1810065E05RikQ5NC41 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
1810065E05RikQ5NC41 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
1810065E05RikQ5NC41 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
1810065E05RikQ5NC41 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
1810065E05RikQ5NC41 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
1810065E05RikQ5NC41 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
1810065E05RikQ5NC41 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
1810065E05RikQ5NC41 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
1810065E05RikQ5NC41 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
1810065E05RikQ5NC41 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
1810065E05RikQ5NC41 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
1810065E05RikQ5NC41 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
1810065E05RikQ5NC41 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
1810065E05RikQ5NC41 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
1810065E05RikQ5NC41 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
1810065E05RikQ5NC41 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
1810065E05RikQ5NC41 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
1810065E05RikQ5NC41 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
1810065E05RikQ5NC41 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
1810065E05RikQ5NC41 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
1810065E05RikQ5NC41 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
1810065E05RikQ5NC41 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
1810065E05RikQ5NC41 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
1810065E05RikQ5NC41 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
1810065E05RikQ5NC41 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
1810065E05RikQ5NC41 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
1810065E05RikQ5NC41 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
1810065E05RikQ5NC41 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
1810065E05RikQ5NC41 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
1810065E05RikQ5NC41 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
1810065E05RikQ5NC41 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
1810065E05RikQ5NC41 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
1810065E05RikQ5NC41 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
1810065E05RikQ5NC41 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
1810065E05RikQ5NC41 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
1810065E05RikQ5NC41 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
1810065E05RikQ5NC41 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
1810065E05RikQ5NC41 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
1810065E05RikQ5NC41 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
1810065E05RikQ5NC41 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
1810065E05RikQ5NC41 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
1810065E05RikQ5NC41 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
1810065E05RikQ5NC41 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
1810065E05RikQ5NC41 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
1810065E05RikQ5NC41 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
1810065E05RikQ5NC41 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
1810065E05RikQ5NC41 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
1810065E05RikQ5NC41 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
1810065E05RikQ5NC41 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
1810065E05RikQ5NC41 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
1810065E05RikQ5NC41 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
1810065E05RikQ5NC41 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
1810065E05RikQ5NC41 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
1810065E05RikQ5NC41 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
1810065E05RikQ5NC41 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
1810065E05RikQ5NC41 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
1810065E05RikQ5NC41 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
1810065E05RikQ5NC41 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
1810065E05RikQ5NC41 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
1810065E05RikQ5NC41 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
1810065E05RikQ5NC41 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
1810065E05RikQ5NC41 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
1810065E05RikQ5NC41 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
1810065E05RikQ5NC41 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
1810065E05RikQ5NC41 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
1810065E05RikQ5NC41 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
1810065E05RikQ5NC41 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
1810065E05RikQ5NC41 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
1810065E05RikQ5NC41 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
1810065E05RikQ5NC41 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
1810065E05RikQ5NC41 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
1810065E05RikQ5NC41 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
1810065E05RikQ5NC41 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
1810065E05RikQ5NC41 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
1810065E05RikQ5NC41 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
1810065E05RikQ5NC41 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
1810065E05RikQ5NC41 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
1810065E05RikQ5NC41 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
1810065E05RikQ5NC41 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
1810065E05RikQ5NC41 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
1810065E05RikQ5NC41 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
1810065E05RikQ5NC41 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
1810065E05RikQ5NC41 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
1810065E05RikQ5NC41 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
1810065E05RikQ5NC41 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
1810065E05RikQ5NC41 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
1810065E05RikQ5NC41 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
1810065E05RikQ5NC41 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms