Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CoblQ5NBX1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CoblQ5NBX1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CoblQ5NBX1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CoblQ5NBX1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CoblQ5NBX1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CoblQ5NBX1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CoblQ5NBX1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CoblQ5NBX1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CoblQ5NBX1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CoblQ5NBX1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CoblQ5NBX1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CoblQ5NBX1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CoblQ5NBX1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CoblQ5NBX1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CoblQ5NBX1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CoblQ5NBX1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CoblQ5NBX1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CoblQ5NBX1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CoblQ5NBX1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CoblQ5NBX1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CoblQ5NBX1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CoblQ5NBX1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CoblQ5NBX1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CoblQ5NBX1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CoblQ5NBX1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CoblQ5NBX1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CoblQ5NBX1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CoblQ5NBX1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CoblQ5NBX1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CoblQ5NBX1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CoblQ5NBX1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CoblQ5NBX1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CoblQ5NBX1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CoblQ5NBX1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CoblQ5NBX1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CoblQ5NBX1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CoblQ5NBX1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CoblQ5NBX1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CoblQ5NBX1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CoblQ5NBX1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CoblQ5NBX1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CoblQ5NBX1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CoblQ5NBX1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CoblQ5NBX1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CoblQ5NBX1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CoblQ5NBX1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CoblQ5NBX1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CoblQ5NBX1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CoblQ5NBX1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CoblQ5NBX1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CoblQ5NBX1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CoblQ5NBX1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CoblQ5NBX1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CoblQ5NBX1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CoblQ5NBX1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CoblQ5NBX1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CoblQ5NBX1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CoblQ5NBX1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CoblQ5NBX1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CoblQ5NBX1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CoblQ5NBX1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CoblQ5NBX1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CoblQ5NBX1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CoblQ5NBX1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CoblQ5NBX1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CoblQ5NBX1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CoblQ5NBX1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CoblQ5NBX1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CoblQ5NBX1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CoblQ5NBX1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CoblQ5NBX1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CoblQ5NBX1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CoblQ5NBX1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CoblQ5NBX1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CoblQ5NBX1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CoblQ5NBX1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CoblQ5NBX1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CoblQ5NBX1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CoblQ5NBX1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CoblQ5NBX1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CoblQ5NBX1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CoblQ5NBX1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CoblQ5NBX1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CoblQ5NBX1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CoblQ5NBX1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CoblQ5NBX1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CoblQ5NBX1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CoblQ5NBX1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CoblQ5NBX1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CoblQ5NBX1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CoblQ5NBX1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CoblQ5NBX1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CoblQ5NBX1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CoblQ5NBX1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CoblQ5NBX1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CoblQ5NBX1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CoblQ5NBX1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CoblQ5NBX1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CoblQ5NBX1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms