Protein–RNA interactions for Protein: Q5G866

Defa23, Alpha-defensin 23, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa23Q5G866 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa23Q5G866 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa23Q5G866 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa23Q5G866 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa23Q5G866 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa23Q5G866 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa23Q5G866 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa23Q5G866 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa23Q5G866 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa23Q5G866 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa23Q5G866 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa23Q5G866 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa23Q5G866 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa23Q5G866 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa23Q5G866 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa23Q5G866 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa23Q5G866 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa23Q5G866 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa23Q5G866 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa23Q5G866 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa23Q5G866 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa23Q5G866 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa23Q5G866 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa23Q5G866 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa23Q5G866 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa23Q5G866 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa23Q5G866 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa23Q5G866 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa23Q5G866 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa23Q5G866 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa23Q5G866 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms