Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccnl1Q52KE7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccnl1Q52KE7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccnl1Q52KE7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccnl1Q52KE7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccnl1Q52KE7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccnl1Q52KE7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccnl1Q52KE7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccnl1Q52KE7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccnl1Q52KE7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccnl1Q52KE7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccnl1Q52KE7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccnl1Q52KE7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccnl1Q52KE7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccnl1Q52KE7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccnl1Q52KE7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccnl1Q52KE7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccnl1Q52KE7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccnl1Q52KE7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccnl1Q52KE7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccnl1Q52KE7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccnl1Q52KE7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccnl1Q52KE7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccnl1Q52KE7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccnl1Q52KE7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccnl1Q52KE7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccnl1Q52KE7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccnl1Q52KE7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccnl1Q52KE7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccnl1Q52KE7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccnl1Q52KE7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccnl1Q52KE7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccnl1Q52KE7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccnl1Q52KE7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccnl1Q52KE7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccnl1Q52KE7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccnl1Q52KE7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccnl1Q52KE7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccnl1Q52KE7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccnl1Q52KE7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccnl1Q52KE7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccnl1Q52KE7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccnl1Q52KE7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccnl1Q52KE7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccnl1Q52KE7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccnl1Q52KE7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ccnl1Q52KE7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ccnl1Q52KE7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccnl1Q52KE7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccnl1Q52KE7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccnl1Q52KE7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccnl1Q52KE7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccnl1Q52KE7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccnl1Q52KE7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccnl1Q52KE7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccnl1Q52KE7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccnl1Q52KE7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccnl1Q52KE7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccnl1Q52KE7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccnl1Q52KE7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccnl1Q52KE7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccnl1Q52KE7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccnl1Q52KE7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccnl1Q52KE7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccnl1Q52KE7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccnl1Q52KE7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccnl1Q52KE7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccnl1Q52KE7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccnl1Q52KE7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccnl1Q52KE7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccnl1Q52KE7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccnl1Q52KE7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccnl1Q52KE7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccnl1Q52KE7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccnl1Q52KE7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccnl1Q52KE7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccnl1Q52KE7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccnl1Q52KE7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccnl1Q52KE7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccnl1Q52KE7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccnl1Q52KE7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccnl1Q52KE7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccnl1Q52KE7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccnl1Q52KE7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccnl1Q52KE7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccnl1Q52KE7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccnl1Q52KE7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccnl1Q52KE7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccnl1Q52KE7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccnl1Q52KE7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccnl1Q52KE7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccnl1Q52KE7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccnl1Q52KE7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccnl1Q52KE7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccnl1Q52KE7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccnl1Q52KE7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccnl1Q52KE7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccnl1Q52KE7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccnl1Q52KE7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccnl1Q52KE7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms