Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syne3Q4FZC9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syne3Q4FZC9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syne3Q4FZC9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syne3Q4FZC9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syne3Q4FZC9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syne3Q4FZC9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syne3Q4FZC9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syne3Q4FZC9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syne3Q4FZC9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syne3Q4FZC9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syne3Q4FZC9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syne3Q4FZC9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syne3Q4FZC9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syne3Q4FZC9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syne3Q4FZC9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syne3Q4FZC9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syne3Q4FZC9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syne3Q4FZC9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syne3Q4FZC9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syne3Q4FZC9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Syne3Q4FZC9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Syne3Q4FZC9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syne3Q4FZC9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syne3Q4FZC9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Syne3Q4FZC9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syne3Q4FZC9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syne3Q4FZC9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syne3Q4FZC9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syne3Q4FZC9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syne3Q4FZC9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syne3Q4FZC9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syne3Q4FZC9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syne3Q4FZC9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syne3Q4FZC9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syne3Q4FZC9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syne3Q4FZC9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syne3Q4FZC9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syne3Q4FZC9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syne3Q4FZC9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syne3Q4FZC9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syne3Q4FZC9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syne3Q4FZC9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syne3Q4FZC9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syne3Q4FZC9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syne3Q4FZC9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syne3Q4FZC9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syne3Q4FZC9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Syne3Q4FZC9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Syne3Q4FZC9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Syne3Q4FZC9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Syne3Q4FZC9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Syne3Q4FZC9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syne3Q4FZC9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syne3Q4FZC9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syne3Q4FZC9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syne3Q4FZC9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syne3Q4FZC9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syne3Q4FZC9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syne3Q4FZC9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syne3Q4FZC9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syne3Q4FZC9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syne3Q4FZC9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syne3Q4FZC9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syne3Q4FZC9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syne3Q4FZC9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Syne3Q4FZC9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syne3Q4FZC9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syne3Q4FZC9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syne3Q4FZC9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syne3Q4FZC9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syne3Q4FZC9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Syne3Q4FZC9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syne3Q4FZC9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syne3Q4FZC9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Syne3Q4FZC9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syne3Q4FZC9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Syne3Q4FZC9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Syne3Q4FZC9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syne3Q4FZC9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syne3Q4FZC9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syne3Q4FZC9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syne3Q4FZC9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syne3Q4FZC9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syne3Q4FZC9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syne3Q4FZC9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syne3Q4FZC9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syne3Q4FZC9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syne3Q4FZC9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syne3Q4FZC9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syne3Q4FZC9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syne3Q4FZC9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syne3Q4FZC9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syne3Q4FZC9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Syne3Q4FZC9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syne3Q4FZC9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Syne3Q4FZC9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syne3Q4FZC9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syne3Q4FZC9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syne3Q4FZC9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms