Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3R4

Itga1, Integrin alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga1Q3V3R4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga1Q3V3R4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga1Q3V3R4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga1Q3V3R4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga1Q3V3R4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga1Q3V3R4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itga1Q3V3R4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itga1Q3V3R4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itga1Q3V3R4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itga1Q3V3R4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itga1Q3V3R4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itga1Q3V3R4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itga1Q3V3R4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itga1Q3V3R4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itga1Q3V3R4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itga1Q3V3R4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itga1Q3V3R4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itga1Q3V3R4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itga1Q3V3R4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itga1Q3V3R4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itga1Q3V3R4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Itga1Q3V3R4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itga1Q3V3R4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itga1Q3V3R4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itga1Q3V3R4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itga1Q3V3R4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itga1Q3V3R4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itga1Q3V3R4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itga1Q3V3R4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itga1Q3V3R4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itga1Q3V3R4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itga1Q3V3R4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itga1Q3V3R4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itga1Q3V3R4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Itga1Q3V3R4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga1Q3V3R4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga1Q3V3R4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga1Q3V3R4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga1Q3V3R4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga1Q3V3R4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga1Q3V3R4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga1Q3V3R4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga1Q3V3R4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga1Q3V3R4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga1Q3V3R4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga1Q3V3R4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga1Q3V3R4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga1Q3V3R4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga1Q3V3R4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga1Q3V3R4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga1Q3V3R4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga1Q3V3R4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itga1Q3V3R4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itga1Q3V3R4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itga1Q3V3R4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Itga1Q3V3R4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Itga1Q3V3R4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga1Q3V3R4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga1Q3V3R4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga1Q3V3R4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga1Q3V3R4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga1Q3V3R4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga1Q3V3R4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga1Q3V3R4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga1Q3V3R4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga1Q3V3R4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itga1Q3V3R4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itga1Q3V3R4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itga1Q3V3R4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itga1Q3V3R4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itga1Q3V3R4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itga1Q3V3R4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itga1Q3V3R4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga1Q3V3R4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga1Q3V3R4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga1Q3V3R4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga1Q3V3R4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga1Q3V3R4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga1Q3V3R4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Itga1Q3V3R4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms