Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pacs2Q3V3Q7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pacs2Q3V3Q7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pacs2Q3V3Q7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pacs2Q3V3Q7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pacs2Q3V3Q7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pacs2Q3V3Q7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pacs2Q3V3Q7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pacs2Q3V3Q7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pacs2Q3V3Q7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pacs2Q3V3Q7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pacs2Q3V3Q7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pacs2Q3V3Q7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pacs2Q3V3Q7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pacs2Q3V3Q7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pacs2Q3V3Q7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pacs2Q3V3Q7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pacs2Q3V3Q7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pacs2Q3V3Q7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pacs2Q3V3Q7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pacs2Q3V3Q7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pacs2Q3V3Q7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pacs2Q3V3Q7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pacs2Q3V3Q7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pacs2Q3V3Q7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pacs2Q3V3Q7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pacs2Q3V3Q7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pacs2Q3V3Q7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pacs2Q3V3Q7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pacs2Q3V3Q7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pacs2Q3V3Q7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pacs2Q3V3Q7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pacs2Q3V3Q7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pacs2Q3V3Q7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pacs2Q3V3Q7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pacs2Q3V3Q7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pacs2Q3V3Q7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pacs2Q3V3Q7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pacs2Q3V3Q7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pacs2Q3V3Q7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pacs2Q3V3Q7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pacs2Q3V3Q7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pacs2Q3V3Q7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pacs2Q3V3Q7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pacs2Q3V3Q7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pacs2Q3V3Q7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pacs2Q3V3Q7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pacs2Q3V3Q7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pacs2Q3V3Q7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pacs2Q3V3Q7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pacs2Q3V3Q7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pacs2Q3V3Q7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pacs2Q3V3Q7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pacs2Q3V3Q7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pacs2Q3V3Q7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pacs2Q3V3Q7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pacs2Q3V3Q7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pacs2Q3V3Q7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pacs2Q3V3Q7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pacs2Q3V3Q7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pacs2Q3V3Q7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pacs2Q3V3Q7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pacs2Q3V3Q7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pacs2Q3V3Q7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacs2Q3V3Q7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacs2Q3V3Q7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacs2Q3V3Q7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacs2Q3V3Q7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacs2Q3V3Q7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms