Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BC051142Q3V0M8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BC051142Q3V0M8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BC051142Q3V0M8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BC051142Q3V0M8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BC051142Q3V0M8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BC051142Q3V0M8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BC051142Q3V0M8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BC051142Q3V0M8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BC051142Q3V0M8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BC051142Q3V0M8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BC051142Q3V0M8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BC051142Q3V0M8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BC051142Q3V0M8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BC051142Q3V0M8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BC051142Q3V0M8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BC051142Q3V0M8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BC051142Q3V0M8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BC051142Q3V0M8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BC051142Q3V0M8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BC051142Q3V0M8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BC051142Q3V0M8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BC051142Q3V0M8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BC051142Q3V0M8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BC051142Q3V0M8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BC051142Q3V0M8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BC051142Q3V0M8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BC051142Q3V0M8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BC051142Q3V0M8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BC051142Q3V0M8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BC051142Q3V0M8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BC051142Q3V0M8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BC051142Q3V0M8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BC051142Q3V0M8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BC051142Q3V0M8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BC051142Q3V0M8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BC051142Q3V0M8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BC051142Q3V0M8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BC051142Q3V0M8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BC051142Q3V0M8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BC051142Q3V0M8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BC051142Q3V0M8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BC051142Q3V0M8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BC051142Q3V0M8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BC051142Q3V0M8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BC051142Q3V0M8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BC051142Q3V0M8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BC051142Q3V0M8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BC051142Q3V0M8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BC051142Q3V0M8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BC051142Q3V0M8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BC051142Q3V0M8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BC051142Q3V0M8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BC051142Q3V0M8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BC051142Q3V0M8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BC051142Q3V0M8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BC051142Q3V0M8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BC051142Q3V0M8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BC051142Q3V0M8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BC051142Q3V0M8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BC051142Q3V0M8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BC051142Q3V0M8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BC051142Q3V0M8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BC051142Q3V0M8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BC051142Q3V0M8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BC051142Q3V0M8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BC051142Q3V0M8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BC051142Q3V0M8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BC051142Q3V0M8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BC051142Q3V0M8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BC051142Q3V0M8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BC051142Q3V0M8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BC051142Q3V0M8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BC051142Q3V0M8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BC051142Q3V0M8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BC051142Q3V0M8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BC051142Q3V0M8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BC051142Q3V0M8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BC051142Q3V0M8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BC051142Q3V0M8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BC051142Q3V0M8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BC051142Q3V0M8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BC051142Q3V0M8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BC051142Q3V0M8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
BC051142Q3V0M8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
BC051142Q3V0M8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BC051142Q3V0M8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BC051142Q3V0M8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BC051142Q3V0M8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BC051142Q3V0M8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BC051142Q3V0M8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BC051142Q3V0M8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BC051142Q3V0M8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BC051142Q3V0M8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BC051142Q3V0M8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BC051142Q3V0M8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BC051142Q3V0M8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BC051142Q3V0M8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BC051142Q3V0M8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BC051142Q3V0M8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms