Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Garnl3Q3V0G7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Garnl3Q3V0G7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Garnl3Q3V0G7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Garnl3Q3V0G7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Garnl3Q3V0G7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Garnl3Q3V0G7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Garnl3Q3V0G7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Garnl3Q3V0G7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Garnl3Q3V0G7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Garnl3Q3V0G7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Garnl3Q3V0G7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Garnl3Q3V0G7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Garnl3Q3V0G7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Garnl3Q3V0G7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Garnl3Q3V0G7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Garnl3Q3V0G7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Garnl3Q3V0G7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Garnl3Q3V0G7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Garnl3Q3V0G7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Garnl3Q3V0G7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Garnl3Q3V0G7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Garnl3Q3V0G7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Garnl3Q3V0G7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Garnl3Q3V0G7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Garnl3Q3V0G7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Garnl3Q3V0G7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Garnl3Q3V0G7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Garnl3Q3V0G7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Garnl3Q3V0G7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Garnl3Q3V0G7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Garnl3Q3V0G7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Garnl3Q3V0G7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Garnl3Q3V0G7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Garnl3Q3V0G7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Garnl3Q3V0G7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Garnl3Q3V0G7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Garnl3Q3V0G7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Garnl3Q3V0G7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Garnl3Q3V0G7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Garnl3Q3V0G7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Garnl3Q3V0G7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Garnl3Q3V0G7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Garnl3Q3V0G7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Garnl3Q3V0G7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Garnl3Q3V0G7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Garnl3Q3V0G7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Garnl3Q3V0G7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Garnl3Q3V0G7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Garnl3Q3V0G7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Garnl3Q3V0G7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Garnl3Q3V0G7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Garnl3Q3V0G7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Garnl3Q3V0G7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Garnl3Q3V0G7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Garnl3Q3V0G7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Garnl3Q3V0G7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Garnl3Q3V0G7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Garnl3Q3V0G7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Garnl3Q3V0G7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Garnl3Q3V0G7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Garnl3Q3V0G7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Garnl3Q3V0G7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Garnl3Q3V0G7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Garnl3Q3V0G7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Garnl3Q3V0G7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Garnl3Q3V0G7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Garnl3Q3V0G7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Garnl3Q3V0G7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Garnl3Q3V0G7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Garnl3Q3V0G7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Garnl3Q3V0G7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms