Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms