Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ57

Axdnd1, Axonemal dynein light chain domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Axdnd1Q3UZ57 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Axdnd1Q3UZ57 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Axdnd1Q3UZ57 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Axdnd1Q3UZ57 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Axdnd1Q3UZ57 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Axdnd1Q3UZ57 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Axdnd1Q3UZ57 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Axdnd1Q3UZ57 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Axdnd1Q3UZ57 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Axdnd1Q3UZ57 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Axdnd1Q3UZ57 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Axdnd1Q3UZ57 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Axdnd1Q3UZ57 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Axdnd1Q3UZ57 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Axdnd1Q3UZ57 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Axdnd1Q3UZ57 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Axdnd1Q3UZ57 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Axdnd1Q3UZ57 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Axdnd1Q3UZ57 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Axdnd1Q3UZ57 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Axdnd1Q3UZ57 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Axdnd1Q3UZ57 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Axdnd1Q3UZ57 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Axdnd1Q3UZ57 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Axdnd1Q3UZ57 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Axdnd1Q3UZ57 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Axdnd1Q3UZ57 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Axdnd1Q3UZ57 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Axdnd1Q3UZ57 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Axdnd1Q3UZ57 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Axdnd1Q3UZ57 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Axdnd1Q3UZ57 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Axdnd1Q3UZ57 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Axdnd1Q3UZ57 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Axdnd1Q3UZ57 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Axdnd1Q3UZ57 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Axdnd1Q3UZ57 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Axdnd1Q3UZ57 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Axdnd1Q3UZ57 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Axdnd1Q3UZ57 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Axdnd1Q3UZ57 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Axdnd1Q3UZ57 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Axdnd1Q3UZ57 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Axdnd1Q3UZ57 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Axdnd1Q3UZ57 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Axdnd1Q3UZ57 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Axdnd1Q3UZ57 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Axdnd1Q3UZ57 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Axdnd1Q3UZ57 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Axdnd1Q3UZ57 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Axdnd1Q3UZ57 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Axdnd1Q3UZ57 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Axdnd1Q3UZ57 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Axdnd1Q3UZ57 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Axdnd1Q3UZ57 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Axdnd1Q3UZ57 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Axdnd1Q3UZ57 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Axdnd1Q3UZ57 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Axdnd1Q3UZ57 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Axdnd1Q3UZ57 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Axdnd1Q3UZ57 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Axdnd1Q3UZ57 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Axdnd1Q3UZ57 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms