Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dnaaf3Q3UYV8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnaaf3Q3UYV8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnaaf3Q3UYV8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnaaf3Q3UYV8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnaaf3Q3UYV8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnaaf3Q3UYV8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnaaf3Q3UYV8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnaaf3Q3UYV8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnaaf3Q3UYV8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Dnaaf3Q3UYV8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dnaaf3Q3UYV8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dnaaf3Q3UYV8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dnaaf3Q3UYV8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dnaaf3Q3UYV8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dnaaf3Q3UYV8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dnaaf3Q3UYV8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
Dnaaf3Q3UYV8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dnaaf3Q3UYV8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dnaaf3Q3UYV8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dnaaf3Q3UYV8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dnaaf3Q3UYV8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dnaaf3Q3UYV8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dnaaf3Q3UYV8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dnaaf3Q3UYV8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dnaaf3Q3UYV8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dnaaf3Q3UYV8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dnaaf3Q3UYV8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dnaaf3Q3UYV8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dnaaf3Q3UYV8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms